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    基于β-微管蛋白基因部分序列探讨灵芝属菌株的亲缘关系


    【发布日期】:2018-05-17  【来源】:菌物学报
    【作者】苏春丽 唐传红 张劲松 潘迎捷
    【机构】南京农业大学生命科学学院微生物系上海农业科学院食用菌研究所上海水产大学食品科学学院 南京210095上海农业科学院食用菌研究所上海201106上海200090
    【摘要】PCR分别扩增了38个灵芝属菌株的β-微管蛋白基因片段,并对PCR产物进行序列测定,得到419bp的一段核苷酸系列。根据MEGA2.1软件中的neighbour-joiningmethods对上述序列进行聚类分析,结果所有供试菌株被分成9个聚类组。中国栽培灵芝菌株分布于6个聚类组,其中树舌亚属、紫芝组的菌株各自聚成一组,灵芝组的菌株分成四组,但大部分灵芝组菌株均聚于同一组,这表明树舌亚属、紫芝组和灵芝组间的遗传差异较大,灵芝组内虽然存在着一定的遗传差异,但总体上亲缘关系比较近,遗传多样性并不丰富。同时,序列分析的结果显示,β-tubulin基因序列在第三位密码子和内含子部位有高的碱基替换率,这些变异提供了丰富的系统发育信息,提示β-tubulin基因适合于灵芝属菌株的亲缘关系研究。 
    【基金】上海市农委重点攻关项目(No.农科攻字2002-1-4-3);
    【关键词】序列分析; neighbour-joiningmethods; 聚类分析; 遗传多样性;
     
     
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