食用菌的种类非常多，其养殖及储藏需要特定的温度，以前由于条件限制，只能是季节性生产，而现在由于有食用菌专用冷库，市场上几乎全年都有食用菌供应，但是食用菌在冷库里的储存过程等也有一些注意事项。
发菌期温度偏高，菌丝迅速老化、衰退，而霉菌则乘虚而入，滋生泛滥。此时要特别注意。 菌丝发好后，温度有所降低，但对子实体发育来说温度仍然偏高（10℃以上），促使菇体徒长，组织疏松，迅速老化、倒伏。菇脚长出很多绒毛，粘连成一体。菇体上部感染霉菌、或生出第二潮小菇，产品失去了商品价值。所以控制发菌期是储藏食用菌的重点。
食用菌冷库的利用大体有三种类型：一是利用冷库群进行周年工厂化生产。将一部分库房变为发菌室，一部分库房改造成出菇室，再配备必要的制种室、拌料场地、灭菌间及原料库，自我完善，自成体系。二是将邻近的库房组成冷库联合体，分工合作，互为补充，按着市场规律协调各个库房的利益。例如由一个库房专门从事制种发菌，其它库房配合进行出菇，由出菇袋的价格去协调各方面的利益关系。也可某一单位租借其它库房作为出菇场地。通过使用以上方法及相关注意事项，可以更高效的培植储存食用菌。
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