【作者】李闯刘娜王鑫许笑蒙申一林邢国珍康振生郑文明
【机构】河南农业大学生命科学学院小麦玉米作物学国家重点实验室河南粮食作物协同创新中心西北农林科技大学植物保护学院旱区作物逆境生物学国家重点实验室
摘要：本研究利用已测序的条形柄锈菌Puccinia striiformis f.sp.tritici基因组序列信息,结合已公布的隐匿柄锈菌Puccinia recondita f.sp.tritici和禾柄锈菌Puccinia graminis f.sp.tritici全基因组编码蛋白序列,运用生物信息数据库和分析软件对其碳水化合物酶类(CAZymes)基因家族进行了注释和比较分析。结果表明,3种小麦锈菌共包含1 232个CAZymes编码基因(含有1 279个模块)。其中,条形柄锈菌具有明显较大的CAZymes家族,3种锈菌的CAZymes具有136个同源基因;相对于隐匿柄锈菌和禾柄锈菌,条形柄锈菌的GH、GT和AA家族发生显著扩增,而3种锈菌的PL家族并无差异;CBM家族则表现为由禾柄锈菌、隐匿柄锈菌到条形柄锈菌的递增式扩增。通过CAZymes、细胞壁降解酶、分泌蛋白、PHI、保守基序等不同形式注释的比较分析表明,对该基因家族而言,条形柄锈菌相对于隐匿柄锈菌和禾柄锈菌呈扩增现象,隐匿柄锈菌和禾柄锈菌的家族缩减水平存在差异。小麦锈菌CAZymes家族整体呈现的不同形式扩增或缩减现象,可能反... 更多
基金：国家重点基础研究发展计划(2013CB127702)； 河南省科技创新杰出人才计划(154200510024)； 河南省重大科技专项(161100110400)~~；
关键词：小麦锈菌; 碳水化合物酶类; 基因家族; 生物信息学分析; 致病性变异;