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大豆疫霉和苜蓿疫霉rDNA ITS序列分析

来源:菌物学报日期:2018-01-29 正文 759 字 · 阅读约 2 分钟256 阅读微博QQ空间复制链接
◆ 内容导读文献 · 第四期

【作者】张正光 王源超 郑小波 【机构】南京农业大学植保学院农业部病虫监测与治理重点开放实验室 南京农业大学植保学院农业部病虫监测与治理重点开放实验室 南京210095 【摘要】采用真菌核糖体基因转录间隔区(ITS)通用引物,PCR分别扩增了Phytophthora sojae的5个菌株(Pg1、Pg2、Pg3、CN1和S317)和1个P. medicaginis (菌株44390)的ITS1与ITS2,并对PCR产物进行了序列测定。根据Bioedit软件中的neighbou... 关键词:Phytophthoramegasperma、P.trifolii、形态…

【作者】张正光 王源超 郑小波
【机构】南京农业大学植保学院农业部病虫监测与治理重点开放实验室 南京农业大学植保学院农业部病虫监测与治理重点开放实验室 南京210095
【摘要】采用真菌核糖体基因转录间隔区(ITS)通用引物,PCR分别扩增了Phytophthora sojae的5个菌株(Pg1、Pg2、Pg3、CN1和S317)和1个P. medicaginis (菌株44390)的ITS1与ITS2,并对PCR产物进行了序列测定。根据Bioedit软件中的neighbour-joining methods分析法将上述序列和Genbank中已登录的P. sojae、P. medicaginis、P. megasperma和P.trifolii等4个形态学种10个登录菌株的ITS1与ITS2碱基序列进行聚类分析。结果是聚类组与形态学种有一定差别,4个种16个菌株分成7个聚类组。结果表明,分别属于同一形态学种且可聚为一组的不同个体之间的ITS碱基序列遗传相似性最高,但是也具有一定的多样性;形态学上属于不同种的个体的ITS可以聚为一组。上述结果提示L41385可能不属于P. sojae, L41380可能属于是P. trifolii,P. megasperma仍是一个复合种。同时提示ITS DNA碱基序列可以区分形态学种。 
【基金】国家重点基础研究发展计划(973计划)(2002CB111402); 国家自然科学基金(30270055); 国家高技术研究发展计划(863计划)(2001AA249021);
【关键词】Phytophthoramegasperma; P.trifolii; 形态学种; 聚类组;Phytophthoramegasperma; P.trifolii; 形态学种; 聚类组;
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