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突脐孢属Brn1基因核苷酸序列比较及系统发育研究

来源:菌物学报日期:2018-02-28 正文 386 字 · 阅读约 1 分钟234 阅读微博QQ空间复制链接
◆ 内容导读文献 · 第四期

【作者】孙广宇 张雅梅 张荣 【机构】西北农林科技大学植保学院西北农林科技大学植保学院 陕西杨凌712100 【摘要】对所有供试突脐孢菌株的Brn1基因 (1, 3, 8 -三羟基萘还原酶基因) 扩增均获得PCR产物。序列比较表明:在种内各菌株间没有核苷酸序列长度变化,存在核苷酸序列简单代换;在种间核苷酸序列长度有变化,核苷酸的缺失或插入发生在内含子区;所有菌株编码区核苷酸序列长度相同;在种内水平氨基酸序列没有差别,显示出高度的保守性。利用最大简约法(Maximum Pars... 关键词:系统发育树;、离蠕孢属;、序列分析;

【作者】孙广宇 张雅梅 张荣
【机构】西北农林科技大学植保学院西北农林科技大学植保学院 陕西杨凌712100
【摘要】对所有供试突脐孢菌株的Brn1基因 (1, 3, 8 -三羟基萘还原酶基因) 扩增均获得PCR产物。序列比较表明:在种内各菌株间没有核苷酸序列长度变化,存在核苷酸序列简单代换;在种间核苷酸序列长度有变化,核苷酸的缺失或插入发生在内含子区;所有菌株编码区核苷酸序列长度相同;在种内水平氨基酸序列没有差别,显示出高度的保守性。利用最大简约法(Maximum Parsimony)和邻近结合法(Neighbor-joining)构建系统发育树,两个系统发育树的拓扑结构相似,不同种在不同的分支上。Brn1基因适合突脐孢属种级水平的分子系统学研究。 
【基金】国家自然科学基金资助项目(项目编号:30170004);
【关键词】系统发育树; 离蠕孢属; 序列分析;
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