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小孢子链格孢endoPG基因核苷酸序列分析及系统发育研究

来源:菌物学报日期:2018-07-18 正文 456 字 · 阅读约 1 分钟239 阅读微博QQ空间复制链接
◆ 内容导读文献 · 第二期

【作者】岳海梅 张荣 孙广宇 【机构】西北农林科技大学植物保护学院西北农林科技大学植物保护学院 杨凌 712100 【摘要】对供试小孢子链格孢菌株的内聚半乳糖醛酸酶(endoPG)基因进行扩增,大部分菌株都可获得PCR产物。核苷酸和氨基酸序列比较表明:不同种小孢子链格孢endoPG基因核苷酸序列存在明显差异,甚至表现在氨基酸水平,这些差异可以作为一些种如梨黑斑链格孢、长柄链格孢区分的分子性状。利用邻近结合法构建系统发育树,所有菌株被分为8个聚类组。在系统发育树上,链格孢的一些... 关键词:内聚半乳糖醛酸酶基因;、链格孢属;、分类;

【作者】岳海梅 张荣 孙广宇
【机构】西北农林科技大学植物保护学院西北农林科技大学植物保护学院 杨凌 712100
【摘要】对供试小孢子链格孢菌株的内聚半乳糖醛酸酶(endoPG)基因进行扩增,大部分菌株都可获得PCR产物。核苷酸和氨基酸序列比较表明:不同种小孢子链格孢endoPG基因核苷酸序列存在明显差异,甚至表现在氨基酸水平,这些差异可以作为一些种如梨黑斑链格孢、长柄链格孢区分的分子性状。利用邻近结合法构建系统发育树,所有菌株被分为8个聚类组。在系统发育树上,链格孢的一些不同分离物被聚在不同组中,而细极链格孢、链格孢的部分菌株、苹果链格孢、柑橘链格孢、粗柠檬褐斑链格孢、橘树链格孢被聚为一组,显示根据形态学特征划分的这些种与分子性状的不一致性。endoPG基因核苷酸序列富于变化,为小孢子链格孢系统发育研究提供了一种有用的手段。 
【基金】国家自然科学基金(No.30670013); 教育部长江学者和创新团队发展计划资助项日(No.200558);
【关键词】内聚半乳糖醛酸酶基因; 链格孢属; 分类;
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