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小孢子链格孢OPA2-1核苷酸序列分析及系统发育研究

来源:菌物学报日期:2019-01-04 正文 479 字 · 阅读约 1 分钟224 阅读微博QQ空间复制链接
◆ 内容导读文献 · 第四期

作者:张荣岳 海梅 孙广宇 机构:西北农林科技大学植物保护学院  西藏大学农牧学院农学系 摘要:本研究采用引物对OPA2-1L/OPA2-1R对供试小孢子链格孢菌株OPA2-1区段进行扩增,所有菌株都可获得PCR产物。核苷酸序列分析表明:不同小孢子链格孢种OPA2-1核苷酸序列存在明显差异。利用邻近结合法构建系统发育树,供试菌株被分为8个组,梨黑斑链格孢Alternaria gaisen、长柄链格孢A.longipes、树状链格孢A.arborescens明显被归于不同分支,... 关键词:链格孢属;、系统发育;、分类;、鉴定;

作者:张荣岳 海梅 孙广宇
机构:西北农林科技大学植物保护学院  西藏大学农牧学院农学系
摘要:本研究采用引物对OPA2-1L/OPA2-1R对供试小孢子链格孢菌株OPA2-1区段进行扩增,所有菌株都可获得PCR产物。核苷酸序列分析表明:不同小孢子链格孢种OPA2-1核苷酸序列存在明显差异。利用邻近结合法构建系统发育树,供试菌株被分为8个组,梨黑斑链格孢Alternaria gaisen、长柄链格孢A.longipes、树状链格孢A.arborescens明显被归于不同分支,显示OPA2-1核苷酸序列对这些种均具有区分能力;链格孢A.alternata的一些不同分离物被聚在不同组中,说明链格孢A.alternata存在明显遗传差异,可能为一个复合体。OPA2-1核苷酸序列富于变化,可作为小孢子链格孢系统发育研究的一种有用的手段。
基金:国家自然科学基金(No.30771735); 教育部长江学者和创新团队发展计划资助项目(No.IRT0748); 高等学校学科创新引智计划项目(No.B07049);
关键词:链格孢属; 系统发育; 分类; 鉴定;
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