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COI基因作为丛赤壳科真菌DNA条形码的测试

来源:菌物学报日期:2019-01-16 正文 331 字 · 阅读约 1 分钟220 阅读微博QQ空间复制链接
◆ 内容导读文献 · 第二期

【作者】赵鹏 罗晶 庄文颖 【机构】中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室鲁东大学菌物科学与技术研究院山东省食用菌技术重点实验室 【摘要】以丛赤壳科33种76个菌株为材料,探讨COI基因作为该科DNA条形码的可能性。结果表明,该DNA片段存在较多内含子,为了获取某些种的短片段,需设计许多引物,PCR扩增与测序成功率低,难以达到便捷、快速的物种鉴定的目的。因此,COI不宜作为丛赤壳科的DNA条形码。对已获得的少数片段进行分析表明,该基因对丛赤壳科部分种具有较强的物种鉴别力。... 关键词:种内与种间差异;、PCR扩增与测序成功率;、邻接树;

【作者】赵鹏 罗晶 庄文颖
【机构】中国科学院微生物研究所真菌学国家重点实验室鲁东大学菌物科学与技术研究院山东省食用菌技术重点实验室
【摘要】以丛赤壳科33种76个菌株为材料,探讨COI基因作为该科DNA条形码的可能性。结果表明,该DNA片段存在较多内含子,为了获取某些种的短片段,需设计许多引物,PCR扩增与测序成功率低,难以达到便捷、快速的物种鉴定的目的。因此,COI不宜作为丛赤壳科的DNA条形码。对已获得的少数片段进行分析表明,该基因对丛赤壳科部分种具有较强的物种鉴别力。  
【基金】国家自然科学基金(No.31070015); 中国科学院知识创新工程项目(No.KSCX2-EW-J-6);
【关键词】种内与种间差异; PCR扩增与测序成功率; 邻接树;
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