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基于LSU和ITS的青藏高原黄绿卷毛菇种群遗传多样性分析

来源:菌物学报日期:2019-01-21 正文 540 字 · 阅读约 1 分钟228 阅读微博QQ空间复制链接
◆ 内容导读文献 · 第一期

【作者】谢占玲 田飞 余静 聂守一 赵联正 张佳伟 雷亚男 郭璟 【机构】青海大学生态环境工程学院国家重点实验室培育基地 青海省高原作物种质资源创新与利用重点实验室 【摘要】为研究黄绿卷毛菇群体遗传结构,以青海、西藏、四川3个省份的10个地理群共91个样本黄绿卷毛菇为实验材料,采用分子生物学方法测定和分析所有样本的LSU和ITS序列。结果显示:1 995bp的LSU和ITS基因序列共有8个变异位点,得到20个基因型。单倍型多样性指数(Hd)和核苷酸多样性指数(pi)分别为0.... 关键词:基于LSU和ITS的青藏高原黄绿卷毛菇种群遗传多样性分析、《菌物学报》、…

【作者】谢占玲 田飞 余静 聂守一 赵联正 张佳伟 雷亚男 郭璟
【机构】青海大学生态环境工程学院国家重点实验室培育基地 青海省高原作物种质资源创新与利用重点实验室
【摘要】为研究黄绿卷毛菇群体遗传结构,以青海、西藏、四川3个省份的10个地理群共91个样本黄绿卷毛菇为实验材料,采用分子生物学方法测定和分析所有样本的LSU和ITS序列。结果显示:1 995bp的LSU和ITS基因序列共有8个变异位点,得到20个基因型。单倍型多样性指数(Hd)和核苷酸多样性指数(pi)分别为0.538±0.026和0.00029±0.00002;青海玉树和青海兴海的遗传多样性指数最高。分子变异分析结果表明黄绿卷毛菇群体遗传变异主要来自种群内(75.70%),种群间遗传分化较大。系统进化树结果也表明,10个地理群分成2个支系,黄绿卷毛菇群体存在明显的地理结构。中性检测结果进一步证实,黄绿卷毛菇群体有着复杂的群体历史,曾发生过种群数量扩张,近期种群数量正在衰减。
【基金】国家自然科学基金(31260021); 青海省科技厅资助项目(2014-Z-903); 青海大学高层次人才项目(2012-QGC-4);
【关键词】黄绿卷毛菇; 核糖体大亚基基因组序列; 内转录间隔区序列; 遗传多样性;
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