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巨大口蘑内参基因的筛选

来源:食用菌学报日期:2019-01-27 正文 544 字 · 阅读约 1 分钟253 阅读微博QQ空间复制链接
◆ 内容导读文献 · 第4期

【作者】刘英 喻晓明 蔡佺佑 吴英 姜子德 莫美华 【机构】华南农业大学食品学院 华南农业大学农学院 摘要:根据巨大口蘑(Tricholoma giganteum)转录组测序组装结果,选取6个组成型表达基因(β微管蛋白基因β-tubulin、肌动蛋白基因act、核糖体蛋白基因60S、烟酰胺腺嘌呤二核苷酸还原酶基因ND、RNA聚合酶Ⅱ基因rpb2、3-磷酸甘油醛脱氢酶基因gapdh)为候选内参基因,结合geNorm、NormFinder以及BestKeeper软件与实时荧光定量... 关键词:巨大口蘑内参基因的筛选、《食用菌学报》、2017年、第4期

【作者】刘英 喻晓明 蔡佺佑 吴英 姜子德 莫美华
【机构】华南农业大学食品学院 华南农业大学农学院
摘要:根据巨大口蘑(Tricholoma giganteum)转录组测序组装结果,选取6个组成型表达基因(β微管蛋白基因β-tubulin、肌动蛋白基因act、核糖体蛋白基因60S、烟酰胺腺嘌呤二核苷酸还原酶基因ND、RNA聚合酶Ⅱ基因rpb2、3-磷酸甘油醛脱氢酶基因gapdh)为候选内参基因,结合geNorm、NormFinder以及BestKeeper软件与实时荧光定量PCR技术,对巨大口蘑各候选内参基因在不同生长阶段(Ⅰ组)、不同组织(Ⅱ组)以及不同亚铁离子浓度胁迫条件下(Ⅲ组)的表达稳定性进行分析。结果表明:β-tubulin基因在供试条件下的相对表达量较稳定,可作为巨大口蘑功能基因转录水平分析的内参基因。
基金:国家自然基金项目(31272218); 广东省科技计划项目(2015A020209144); 广东省科技计划项目(2013B020502019); 广州市2017年产学研协同创新重大专项(201704020020); 广州市应用基础研究专项项目(2012J4100125)资助;
关键词:巨大口蘑; 实时荧光定量PCR; 内参基因; β-tubulin;
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