灵芝栽培种制作的工艺流程是拌料→装瓶(袋)→灭菌→接种→菌种培养。
一、常用灵芝栽培种培养料配方
(一)木屑74％，玉米粉24％，石膏l％，蔗糖1％，含水60％-65％。
(二)棉籽壳78％，米糠或麦麸20％，石膏或石灰1％，蔗糖1％，含水量60％-65％。
(三)木屑40％，棉籽壳40％，玉米粉18％，石膏l％，蔗糖1％，含水量60％-65％。
(四)木屑78％，米糠或麦鼓15％，玉米粉5％，石膏、蔗糖各l％，含水量60％-65％。
三、装瓶或装袋
栽培种可瓶装，也可袋装，瓶装方法与原种制作方法相同。 装袋的方法：作栽培种的袋子一般选用规格为17x 33米的折角袋。高压灭菌则选用聚丙烯塑料袋，常压则可用聚乙烯袋。折角袋必须厚薄均匀，无砂眼。装袋时，先把折角袋的四个角用培养料充实，左手扯袋，右手灌充培养料。装袋松紧要适当，一般装袋长的二分之一，然后表面用手压实，培养料装好后，套上套环，盖上套盖，也可用纤维绳或橡皮筋扎好。
四、灭茵
瓶装栽培种灭菌方法与原种灭菌方法相同。
五、接种
灭菌后的瓶子或袋料从锅中取出，冷却到室温。搬运时动作要轻。移入接种箱接种，接种方法与原种接种方法大致相同。接种时，先将原种瓶装菌种表面老化的菌皮除去，用镊子夹取蚕豆大的菌丝块，解开棉塞或套环，迅速移入瓶或塑料袋中，再塞上棉塞或扎好袋口。一般一瓶原种接30-40瓶(袋)。栽培种，适当加大菌种量可促进菌丝"吃"料。
六、栽培种的培养
裁培种接好以后小心移入培养室中培养，方法与原种的培养大致相同。瓶子和袋子一般放在培养室的培养架上，摆放时，如是菌袋不宜堆放太高太紧，否则袋料通气不良，影响茵丝生长，且散热难，温度容易上升，易产生烧堆使菌丝烧坏，影响菌种质量。
