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糙皮侧耳不同单核体基因序列的保守性分析

来源:菌物学报日期:2019-01-21 正文 334 字 · 阅读约 1 分钟210 阅读微博QQ空间复制链接
◆ 内容导读文献 · 第二期

【作者】曲积彬 张金霞 陈强 黄晨阳 【机构】中国农业科学院农业资源与农业区划研究所 【摘要】从已公布的糙皮侧耳基因组信息入手,用全局比对法计算两个不同单核之间基因序列的相似性,这种相似性与基因序列的保守性有关。通过对保守和不保守的基因集合进行功能富集分析研究,分析与序列保守性相关的Gene Ontology功能。保守基因集合中显著富集的主要是一些代谢过程、催化酶活性、输送等功能。不保守基因集合中显著富集的多为激酶活性、绑定、调控等功能。  【基金】国家重点基础研究发展计划(... 关键词:基因组;、全局比对;、基因本体论;、功能富集分析;

【作者】曲积彬 张金霞 陈强 黄晨阳
【机构】中国农业科学院农业资源与农业区划研究所
【摘要】从已公布的糙皮侧耳基因组信息入手,用全局比对法计算两个不同单核之间基因序列的相似性,这种相似性与基因序列的保守性有关。通过对保守和不保守的基因集合进行功能富集分析研究,分析与序列保守性相关的Gene Ontology功能。保守基因集合中显著富集的主要是一些代谢过程、催化酶活性、输送等功能。不保守基因集合中显著富集的多为激酶活性、绑定、调控等功能。 
【基金】国家重点基础研究发展计划(No.2014CB138303); 国家科技支撑计划课题:食用菌新品种培育及制种关键技术研究(No.2013BAD16B02);
【关键词】基因组; 全局比对; 基因本体论; 功能富集分析;
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