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文献内容 17210▲ 已收录 当前栏目 9▼ 第四期 本页阅读 253▲ 实时 互动评论 0▲ 2019-01-25

金针菇HMG-box转录因子鉴定及一个候选基因的差异表达分析

来源:菌物学报日期:2019-01-25 正文 623 字 · 阅读约 2 分钟253 阅读微博QQ空间复制链接
◆ 内容导读文献 · 第四期

【作者】孟丽 王丽 刘芳 丑天胜 王威谢 宝贵 【机构】山东农业大学植物保护学院山东省农业微生物重点实验室福建农林大学菌物研究中心 摘要:食用菌的原基形成受到环境因子和内源基因的共同调控,转录因子在其生长发育过程中能够起到关键作用。本研究在已测序金针菇单核菌株L11全基因组中鉴定到29个高速泳动蛋白(high-mobility-group box,HMG-box)转录因子编码基因。基于金针菇双核菌株H1123各发育时期转录组数据,筛选到一个与金针菇原基形成相关的HMG-box... 关键词:金针菇;、原基形成;、高速泳动蛋白;、转录因子;

【作者】孟丽 王丽 刘芳 丑天胜 王威谢 宝贵
【机构】山东农业大学植物保护学院山东省农业微生物重点实验室福建农林大学菌物研究中心
摘要:食用菌的原基形成受到环境因子和内源基因的共同调控,转录因子在其生长发育过程中能够起到关键作用。本研究在已测序金针菇单核菌株L11全基因组中鉴定到29个高速泳动蛋白(high-mobility-group box,HMG-box)转录因子编码基因。基于金针菇双核菌株H1123各发育时期转录组数据,筛选到一个与金针菇原基形成相关的HMG-box转录因子基因Fv-hmg。通过同源比对发现Fv-hmg的DNA序列在6个不同金针菇菌株中十分保守,一致性为98.38%,有92个SNP位点。克隆分析表明,该基因长度为1 517bp,含有一个内含子。该基因编码489个氨基酸残基的蛋白序列,含有一个HMG-box结构域。通过实时荧光定量PCR和转录组测序共同分析表明,该基因在金针菇原基时期的表达量比双核菌丝时期高达4倍以上,具有显著性差异(P<0.01),由此推测该转录因子参与调控金针菇的原基形成。HMG-box转录因子Fv-Hmg在金针菇原基形成过程中的作用仍需进一步研究。 
 
基金:国家重点基础研究发展计划(2014CB138302); 山东省自然科学基金(ZR2016CL13); 山东省农业微生物重点实验室开放课题基金(SDKL2017015)~~;
 
关键词:金针菇; 原基形成; 高速泳动蛋白; 转录因子;
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