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比较形态学、聚丙酰胺凝胶电泳与二代测序在AM真菌群落研究中的应用

来源:菌物学报日期:2019-01-26 正文 478 字 · 阅读约 1 分钟252 阅读微博QQ空间复制链接
◆ 内容导读文献 · 第九期

【作者】成斌 许伟 胡从从 贺学礼 赵丽莉 【机构】河北大学生命科学学院兰州大学生命科学学院 摘要:采集内蒙古荒漠草原沙化梁地羊柴Hedysarum laeve根围土样,采用形态学方法、聚丙酰胺凝胶电泳(denatured gradient gel electrophoresis,DGGE)技术和二代测序(next generation sequencing,NGS)技术分析羊柴根围AM真菌群落组成和多样性。结果表明,应用NGS共鉴定AM真菌3纲4目10科18属,DGGE鉴定... 关键词:AM真菌;、形态学方法;、二代测序;、群落结构和多样性;、荒漠生境;

【作者】成斌 许伟 胡从从 贺学礼 赵丽莉
【机构】河北大学生命科学学院兰州大学生命科学学院
摘要:采集内蒙古荒漠草原沙化梁地羊柴Hedysarum laeve根围土样,采用形态学方法、聚丙酰胺凝胶电泳(denatured gradient gel electrophoresis,DGGE)技术和二代测序(next generation sequencing,NGS)技术分析羊柴根围AM真菌群落组成和多样性。结果表明,应用NGS共鉴定AM真菌3纲4目10科18属,DGGE鉴定2纲2目2科5属,形态学鉴定1纲2目2科3属。AM真菌分类等级越低,NGS、DGGE和形态学鉴定结果差异越大,尤其在属水平上差异显著。与NGS技术相比,形态学和DGGE方法所反映AM真菌种类主要为优势菌种,显著低估了AM真菌物种组成并高估其丰度,分子测序是对形态学分类的补充和完善。 
 
基金:国家自然科学基金(31270460,31470533); 河北省自然科学基金(C2014201060)~~;
 
关键词:AM真菌; 形态学方法; 二代测序; 群落结构和多样性; 荒漠生境;
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