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孢蘑菇Septin基因Ab.Cdc3的克隆与分析

来源:菌物学报日期:2019-01-26 正文 633 字 · 阅读约 2 分钟311 阅读微博QQ空间复制链接
◆ 内容导读文献 · 第十二期

【作者】卢园萍 郭仲杰 蔡志欣 施肖堃 陈美元 廖剑华 王泽生 【机构】福建省农业科学院食用菌研究所特色食用菌繁育与栽培国家地方联合工程研究中心 摘要:具有GTPase活性的Septin蛋白广泛存在于除植物外的所有真核生物中,其功能多样。采用tBlastn将灰盖鬼伞Coprinuscinereus中与菌柄伸长相关的Septin蛋白Cc.Cdc3与双孢蘑菇基因组数据进行比对,在双孢蘑菇基因组中找到Cc.Cdc3同源蛋白编码基因Ab.Cdc3。生物信息学分析结果表明,Ab.Cdc... 关键词:食用菌;、实时荧光定量PCR;、保守结构域;、GTP结合蛋白;

【作者】卢园萍 郭仲杰 蔡志欣 施肖堃 陈美元 廖剑华 王泽生
【机构】福建省农业科学院食用菌研究所特色食用菌繁育与栽培国家地方联合工程研究中心
摘要:具有GTPase活性的Septin蛋白广泛存在于除植物外的所有真核生物中,其功能多样。采用tBlastn将灰盖鬼伞Coprinuscinereus中与菌柄伸长相关的Septin蛋白Cc.Cdc3与双孢蘑菇基因组数据进行比对,在双孢蘑菇基因组中找到Cc.Cdc3同源蛋白编码基因Ab.Cdc3。生物信息学分析结果表明,Ab.Cdc3蛋白序列具有保守GTPase结构功能域。通过荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)方法分析Ab.Cdc3在不同生长阶段的表达模式,结果显示该基因在子实体菌柄中表达量较菌丝、原基和菌盖中的表达量高;采后不同保藏时间样品Ab.Cdc3基因表达分析结果显示,在采后0h表达量显著高于采后12h和48h;这些结果为进一步研究该基因在双孢蘑菇生长发育中的功能提供参考。 
 
基金:福建省农业科学院博士基金项目(DC2018-4); 福建省农业科学院科技创新团队(STIT2017-1-6); 国家现代农业产业技术体系专项资金(CARS20); 福建省属公益类科研院所基本科研专项(2015R1020-1); 福建省种业创新与产业化工程项目(fjzycxny2017009)~~;
 
关键词:食用菌; 实时荧光定量PCR; 保守结构域; GTP结合蛋白;
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