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光照胁迫下广叶绣球菌菌丝基因差异表达的初步分析

来源:中国食用菌日期:2019-01-31 正文 403 字 · 阅读约 1 分钟252 阅读微博QQ空间复制链接
◆ 内容导读文献 · 第5期

【作者】肖冬来 张迪 马璐 王宏雨 林衍铨 【机构】福建省农业科学院食用菌研究所 摘要:利用高通量测序技术对黑暗和光照下广叶绣球菌(Sparassis latifolia)菌丝进行RNA-Seq分析,比较光照胁迫下的差异表达基因,并对差异基因进行GO功能分析和KEGG pathway分析。结果表明,光照胁迫下显著性差异表达的基因328个,其中,上调、下调表达的基因数分别为157个和171个。差异表达基因的GO注释表明,生物学过程主要为细胞过程、代谢过程、单一生物过程,而分子功... 关键词:光照胁迫下广叶绣球菌菌丝基因差异表达的初步分析、《中国食用菌》、2017…

【作者】肖冬来 张迪 马璐 王宏雨 林衍铨
【机构】福建省农业科学院食用菌研究所
摘要:利用高通量测序技术对黑暗和光照下广叶绣球菌(Sparassis latifolia)菌丝进行RNA-Seq分析,比较光照胁迫下的差异表达基因,并对差异基因进行GO功能分析和KEGG pathway分析。结果表明,光照胁迫下显著性差异表达的基因328个,其中,上调、下调表达的基因数分别为157个和171个。差异表达基因的GO注释表明,生物学过程主要为细胞过程、代谢过程、单一生物过程,而分子功能主要为催化、结合和转运子活性。KEGG pathway功能分析结果表明,差异基因主要集中在次级代谢产物合成、淀粉和蔗糖代谢和谷胱甘肽代谢通路中。 
基金:福建省属公益类科研院所基本科研专项(2015R1020-5); 福建省自然科学基金(2016J01133);
关键词:广叶绣球菌; 转录组; GO功能分析; 差异表达基因;
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