除枝条外，也可采用筷子来制作二级菌种（原种）：
筷子二级菌种的优点
1. 生产成本低
原来木屑菌种每亩需要200瓶二级种，每瓶造价1.8元，计360元，而木条菌种每亩只需25袋（2500双筷子），可接三级种2500袋，每袋造价2元，计50元，即每亩可节省310元。
2. 木条菌种质量较高
直接用颗粒一级种转接，菌种长速快，菌丝粗壮，污染率较低，菌龄短而一致，避免了木屑菌种袋上老化、袋下面还没长好的缺点，菌种纯度高，抗杂能力强。
3. 节省劳力，方便接种
使用木屑二级种转接三级种2500袋，需人工8个，劳动强度大。用筷子种转接三级种，只需4人2小时就可接完，劳动效率提高八成。
4. 占地少，培养周期短，节省燃料。
木条二级菌种制做方法
1. 选料
选无硫磺熏蒸的方便筷，不掰开，直接削尖。
2. 配料
2500袋三级种需25袋筷子种（每袋100双），辅料用2kg硬木屑、粗麦麸0.4kg、白糖25g、石膏25g，配成含水量60%的填充料。筷子用1.5kg白糖兑水100kg浸泡。
3. 制做
用方便筷制做，每100双装1袋，每亩或每棚准备2500双筷子，削尖。筷子之间要留空隙，不但通风好，也利于接种时菌种落入筷子中间和袋底。
3.1 方法 将筷子放入容器中，用重物压上，用1.5%糖水没过筷子浸泡12小时，亦可用糖水煮20分钟，让筷子充分吸湿，无干心即可捞出，在配制好的辅料中滚动，沾上一定量的配料后装袋，装袋前要在袋底撒1层配料，防止筷子扎破袋底，然后扎口。
3.2 装袋 筷子之间要留缝隙，以便菌种可以落入菌袋底部和筷子之间，可以使菌袋透气好，还可让菌丝上下同时萌发生长，使三级菌种菌龄短而一致。
4. 灭菌
高压灭菌要求在1.5kg/平方厘米压力下灭菌1.5～2小时。常压灭菌应在温度达到100℃的条件下灭菌10～12小时。
5. 接种
灭菌后趁热将料袋搬入接种室或冷凉、消毒，温度降到25℃以下时方可接种。先打开扎口绳，将事先准备好的谷粒母种1瓶（500mL）转接4～5袋。菌种接入后马上扎口，同时一手提袋口，一手托起菌袋晃动，使一部分菌种落入筷子缝隙中和底部，然后上架培养。
6. 培养
菌种培养环境要求干燥、清洁、恒温、无光、空气流通，温度24℃，后期可降到20℃，20天左右菌丝可长满袋，在10℃低温下复壮10天，让菌丝深入筷子木质中，使接种后萌发速度快而洁白整齐。
7. 筷子接三级种方法
三级木屑菌种装袋、灭菌方法和出锅冷凉与过去一样，只是用筷子接种时则不同。现简要介绍如下：
接种在无菌室或离子风机下进行，接种前地面要用来苏儿洒湿，空间要严格消毒。4人1组流水作业，1个人将菌袋递到撕中台上，袋口朝下；1个人用酒精脱脂棉或来苏儿消毒布擦洗菌袋底部；1个人从木条菌袋中抽出1双筷子种迅速插入袋的两侧，不要太靠边，否则容易穿破菌袋。筷子种末端留1cm在袋外（起到封闭作用，后期缺氧时，可转动筷子，增加料内氧气）。一人将接好的菌袋轻拿轻放，横放在培养架上进行培养。
也可以在接三级种时，把灭菌后的三级菌种袋出锅时直接摆到培养架上，同时将培养室一同消毒杀菌。冷凉到25℃以下时，整双筷子（两根筷子中间夹的菌丝不脱落）在绑口找压褶处（无菌）直接插入料内，留1cm封口，不要碰掉筷子封口处四周的菌丝（由粘在筷子外的培养料堆积而成）。像这样直接在培养架上接种，可以解决因搬动筷子松动问题，减少出现微孔使三级菌种出现感染的现象，但要将培养室彻底杀菌，而且不要在接种后再出热料到培养室中，防止热气杀伤接好种的菌丝。
