贵州作为全国典型的喀斯特山区省份，生态类型多样，生物多样性突出，食用菌资源及类型丰富。为充分利用我省食用菌资源与气候生态环境，加强食用菌基础及应用研究，“十一五”期间，院成立了食用菌研究团队，食用菌科技支撑及平台建设和基础研究跃上新台阶。
近年来，食用菌研究团队在国家科技支撑、星火计划、科技富民强县专项、省农业攻关和省优秀青年科技人才计划等项目支持下，围绕竹荪、姬松茸、大球盖菇和灰树花等优良菌株选育和配套栽培技术开展研究。迄今，共收集大型真菌红托竹荪、白鬼笔(冬荪）、蘑菇属真菌、姬松茸等资源1000多份，发现贵州蘑菇属真菌3个新种、3个新记录种，集成竹荪发酵菌棒栽培技术和白鬼笔高产栽培技术，形成了一支博士2人、硕士6人、研究员1人、副研究员4人、贵州省优秀青年科技人才培养对象1人的食用菌人才队伍；发表SCI 等论文41篇，获发明专利5个。
食用菌团队在强化基础研究的同时，注重科技支撑产业服务，将集成熟化的冬荪高产栽培技术、红托竹荪发酵栽培技术、姬松茸高产栽培技术、姬松茸和大球盖菇接茬模式等技术在大方、百里杜鹃、义龙新区、赫章、清镇等县（市、区）现代高效农业示范园区示范和大面积推广，取得了显著的社会经济效益。
为深化科技体制改革，贯彻落实省深化科技体制改革专题组“八条措施”，探索科技成果转化及产业化服务的体制机制，有效激发科技人员创新创业活力，促进科学研究与经济发展的有效耦合，食用菌团队携带科技成果，发挥人才优势，入驻义龙新区珍稀食用菌园区，指导园区姬松茸全产业链发展。
“十一五”以来，院食用菌团队强化与国内科研院所、高校、企业合作与交流，推进贵州食用菌产业发展科技支撑能力提升。一是与国家食用菌工程技术研究中心合作，在义龙新区共建“国家食用菌工程技术研究中心贵州研发基地”，进一步强化食用菌研发平台；二是组织全省相关领域专家和企业，成立“贵州省微生物学会食药用菌专业委员会”，建立“贵州食药用菌产业信息网”，组织开展全省食用菌产业考察并形成调研报告，引领食用菌产业健康可持续发展。
