内蒙古自治区食用菌协会是内蒙古自治区供销合作社联合社为贯彻落实《国务院办公厅关于加强鲜活农产品流通体系建设的意见》（国办发〔2011〕59号），加强对同属于鲜活农产品的食用菌产业生产、流通、销售等环节的服务，积极为我区食用菌行业争取政策、资金、项目支持，提升我区食用菌产业的科技和标准化水平，打造名牌、培育龙头，探索提升我区食用菌产业链条各个环节核心竞争力的途径，助推全区食用菌产业快速健康发展，而决定成立的全区性行业组织。
内蒙古自治区食用菌协会的业务主管单位是内蒙古自治区供销合作社联合社，牵头筹建单位是区社直属企业内蒙古绿泰源农产品开发有限公司。
