目前我国食用菌总产量占全球75%以上。从2008年到2016年工厂化的企业数量逐渐上升，到现在为止已经达到接近600家。工厂化产能目前稳居全球首位，占全球食用菌工厂化总产量的43%，2010年到2016年日产量可以达到7000多吨，这是其他国家不能比拟的。
2015年我国食用菌工厂化品种最多的是金针菇，其次是杏鲍菇，其他包括香菇、蟹味菇等。超市里能看到的种类不断丰富。全国食用菌类的出口额稳步上升，2016年同比增长8%，超过30多亿美元。全国食用菌上市企业也在突飞猛进地增加，近几年来，15家食用菌企业和8家药用菌企业分别在主板、新三板和中小企业板上市，很多资金进入这一产业。
现在中国大面积种植的香菇，基本上都是一个妈的孩子，都是从日本引进的最早的香菇品种繁衍下来的，这是非常严重的问题。菌种混乱、品种混杂、质量标准不统一，几乎全部为国外品种垄断，木腐菌品种来自日韩，草腐菌品种来自欧美，我们自有知识产权的品种还没有。食用菌的菌种是这个产业可持续的起点，应该紧紧抓在我们自己手里。
精深加工能力不足也是制约我国食用菌产业的一个问题。我国食用菌加工品种500多种，加工率只有6%，而国外的加工率达到75%。
菌物研究还有很多延伸领域，比如药业。建议把“菌物药”纳入中药范畴。目前看来，利用菌物药生产的一些新型的可以治疗疑难杂症的药剂，有非常广阔的前途。比如日本生产的一种肿瘤切除术后使用的注射药物——天地欣，成分就是香菇多糖，一针卖到1680元。但中国没有一家企业能生产出这种高纯度的同类药物，类似的例子非常多。
