在福州举办的中国菌物学会2024年学术年会上，福建农林大学邓优锦副教授做了题为草菇主栽品种NF-7全基因组分子标记的构建的报告分享。
食用菌作为一类具有食药用功能的大型真菌，在推动循环农业和提高农民收入方面发挥了重要作用，也是脱贫攻坚的重要产业。然而，近年来随着品种选育和引种栽培的快速推进，食用菌品种名称的混乱问题日益凸显，“同物异名、异物同名”的现象普遍存在，给食用菌生产带来了不必要的困扰，也对种质创新造成了严重的阻碍。
草菇是发源于中国最著名的食用菌之一。因其在自然状态下草菇生长在稻草堆中，俗称“秆菇”(稻草菇)，也被称为“中国蘑菇”。作为高温食用菌和草生食用菌的代表，草菇的栽培周期极短，仅需14天，而备受青睐。因此邓优锦副教授带领团队对草菇主栽品种NF-7进行了深入的全基因组分子标记研究。他们首先进行了草菇NF-7的异核基因组组装，成功获得了核A、核B的完整基因组序列以及线粒体基因组序列，并揭示了三者间的比例关系，从而全面掌握了草菇NF-7的遗传信息。
在基因组组装质量验证方面，邓优锦副教授采用了多种方法进行验证，包括正向验证、反向验证、异核分型验证以及染色体构架验证等，确保了基因组组装的准确性和完整性。他们还利用Hi-C交联信号揭示了每条染色体构架的准确性，进一步提高了基因组组装的可靠性。
基于全基因组信息，邓优锦副教授开发了一套分子标记鉴定流程。该流程通过将待测菌株的基因组序列分割成100-bp片段集，并与参考基因组进行比对，从而计算出SNP数量，进而实现菌株的快速准确鉴定。该鉴定流程具有检测准确性高、操作简便等优点，可广泛应用于食用菌产业的品种鉴定和种质创新中。
此外，邓优锦副教授还利用该分子标记鉴定流程对菇厂采集的菌株进行了鉴定，成功区分了不同来源的菌株，为食用菌产业的种质资源管理和品种选育提供了有力支持。
据悉，由中国菌物学会主办的“2024年中国菌物学前沿论坛，并在同期召开中国菌物学会第八届理事会会议及《菌物学报》《菌物研究》编委会”将于12月27日至31日在海南海口举行。届时，邓优锦副教授将再次与大家相聚，并作题为“银耳异核基因组非对称现象及其附属染色体多样性分析”的报告分享，欢迎广大从业者参会交流！
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