从海关方面获悉，食用菌出口当前还面临着五大壁垒的阻碍：
物种壁垒。日本于今年4月实施《种苗修正案》，对22类145种食用菌实施保护，加收专利费。
绿色壁垒。发达国家通过立法等形式，制订苛刻的技术标准，对农药残留、放射性残留、金属含量、化学添加剂等均有严格要求。据企业反映，最近新加坡对我干香菇检测重金属项目多达6个（砷、铅、汞、铜、镉、硒），对砷、汞的检测分别高出国际1倍和4倍。
认证壁垒。美国现有认证体系多达55种，输欧食用菌未经认证就不能进欧盟市场，大部分菌农和食用菌生产企业对这些体系了解不多。
标准壁垒。世界各国技术标准十分复杂，且名目繁多，如欧洲技术标准有10万多个，其中有些标准是专门针对某国或某类产品而专门设计制定的。
包装壁垒欧盟、美国、日本对食用菌包装材料及包装标签要求十分严格，如包装物要节约能源、无废弃物产生、绝对不污染环境等，标签要求有图形、图案标明和文字说明。
