黑木耳绿霉病
症状
菌袋、菌种瓶、段木接种孔周围及子实体受绿霉菌感染后，初期在培养料段木或子实体上长白色纤细的菌丝，几天之后，便可形成分生孢子，一旦分生孢子大量形成或成熟后，菌落变为绿色，粉状。
病原
常见的绿霉菌有绿色木霉菌，康氏木霉菌，木素木霉菌等，属半知菌亚门，丝孔纲、丛梗孢目、淡色菌科，该病菌在马铃薯蔗糖琼脂培养基上生长时，菌丝白色、纤细，分生孢子梗从菌丝上长出与菌丝无显著区别，分生孢子小梗着生形式不一，瓶梗式小梗顶端着生分生孢子，常常聚生成团，分生孢子圆形或椭圆形、单细胞、无色、大小与霉菌的分生孢子相近。
发生
绿色木霉菌广泛存于自然界的各种有机物质上和土壤中，空气中也到处漂浮有绿色木霉病菌的分生孢子。
代料栽培黑木耳，各种机会都有可能将抱子带入木屑、棉子壳、稻草等培养料和生长弱的子实体上形成菌落。采耳后的耳根很容易受绿霉菌的感染。该菌适宜于高温、高湿和培养料偏酸性的条件下发生，发生的最适温度为25℃，湿度为95％左右，酸碱度为pH3.5～6.0。主要靠分生雹孢子借助空气传播。
防治
1．保持耳场、耳房及其周围环境的清洁卫生。
2．耳房、耳场必须通风良好，排水便利。
3．出耳后每三天喷1次1％石灰水，有良好的防霉作用。
4．若绿霉菌发生在培养料的表面，尚未深入料内时，用pH10的石灰水擦洗患处，可控制绿霉菌的生长。
蓟马
蓟马俗称爬竿虫，主要危害木耳。成虫黑色，体小，细长而略扁，复眼突出，翅膜质，狭长形。若虫红色，很象成虫，共分4龄，3龄前现翅芽，俗称小红虫，钻出耳片后能弹跳；4龄后进入蛹期。从若虫开始危害木耳，侵入耳片后吮吸汁液，使耳片萎缩，严重时造成流耳。
蓟马发生后，用500～1000倍的40％乐果乳剂。1000～1500倍的50％可湿性的敌百虫药液、1500倍的马拉硫磷喷杀。
烂耳（又名流耳）
症状
耳片成熟后，耳片变软，耳片甚至耳根自溶腐烂。
病原
黑木耳流耳是细胞充分破裂一种生理障碍现象，黑木耳在接近成熟时期，不断地产生担孢子，消耗子实体里面的营养物质。使子实体趋于老化，此时遇到过大的湿度极容易溃烂。在温度较高时，特别是湿度较大，而光照和通气条件又比较差的环境中，子实体常常发生溃烂。细菌的感染和害虫的危害也是造成烂耳的原因之一。
发生
耳片成熟时，若此时持续高温，高湿、光照差、通风不良，常造成大面积烂耳。代料栽培黑木耳，培养料过湿，酸碱度过高或过低，影响黑木耳正常生长而造成烂耳。
防治
1．针对上述发生烂耳的原因加强栽培管理，注意通风换气，光照等。
2．及时采收，耳片接近成熟或已经成熟立即采收
3．可用25ppm的金霉素或土霉素溶液喷雾，防止流耳。
耳菌块防霉菌
产生原因
木耳菌块防霉霉菌污染是导致木耳菌块减产，影响产品质量的一个重要原因，严重时使生产完全失败，木耳菌丝纤细，生长缓慢，抗杂菌能力差；菌块外部不能形成皮膜状的保护层，这是木耳菌丝不利于菌块栽培的一个主要弱点。另一方面，栽培管理措施不当，又为杂菌大量滋生创造了条件，培养基含氮物质（如麦麸）过于丰富，可溶性糖类含量过多（如玉米芯）；培养基灭菌不彻底；菌种质量不纯，或木屑菌种多次代传，降低菌种生活力；塑料袋韧性差，在操作管理中被刺破；环境条件差，均能导致霉菌发生。青霉、木霉是木耳菌块上最常见的杂菌，往往在菌丝体压块或塑料袋开洞培养时出现暴发性危害；若将菌丝尚未满瓶的菌种压块，无菌丝的料团很容易生长青霉和木霉；菌丝压块后，在菌丝尚未完全恢复前便过早地揭膜，也容易滋生霉菌，并直接深入到菌块内。菌块培养过程中，由于管理不善，易造成木耳菌丝衰老死亡，也容易滋生杂菌。如菌块含水量过低，干缩部分的菌丝常老化衰退：菌块含水量过重，积水部分的菌丝常厌气死亡，杂菌菌丝便常出现在木耳菌丝衰退的部位。在环境不良的条件下进行开洞培养，洞口很快出现大量杂菌。霉菌发生后，不但影响到优良菌块的培育，当子实体形成后，还会侵染子实体，造成腐烂。
防霉措施
①选用抗霉能力较强的菌株，特别是对木霉抗性较强的菌株供菌块栽培用，切勿使用生活力衰退的菌种。
②选用新鲜原材料越夏。隔年的棉壳或玉米芯，在堆放中受潮，很容易生长青霉或木霉，采用常压灭菌很难彻底根除。麦麸的用量一般不要超过10％，含氮物质过多反而容易造成污染，或适量减少有机氮，增加无机氮用量。培养料如有必要加入糖类时，据日本介绍经验，最好用葡萄糖而不要用蔗糖，因葡萄糖易于被木耳吸收，并能抗拒木霉污染，糖的用量一般不要超过1％。在培养料内酌加适量无机盐和微量元素，能加快木耳菌丝生长速度，提高抗菌能力。
③在培养料中增添抗霉剂，目前认为比较有效的方法是用0.1％高锰酸钾水溶液，或用石灰清水拌料，后者还能防治培养料偏酸。木霉对pH的最高耐受力为11，可用1％石灰清液（pH约在13左右，使用时预先测定，低于pH13，应酌加石灰调整）拌料，能有效地杀灭木霉，然后用0.5％～1％过磷酸钙溶液调出至8～9，即可满足木耳菌丝生长的要求。在培养基内加入0.5％紫苏茎叶粉也有防霉作用。
④用已经满瓶的菌种压块，挖瓶。压块用具和薄膜都要用0.1％高锰酸钾溶液消毒。压块后1周时间内，菌丝尚未完全恢复，若有霉菌出现，可用饱和石灰水上清液涂抹患处；严重时，用0.1％高锰酸钾擦洗1～2次，大通风2～3天，再盖膜培养，仍可出耳。菌丝尚未愈合前，不要揭开薄膜。袋栽木耳如需打孔，在打孔之前，应将塑料袋浸人0.1％高锰酸钾溶液中消毒。打孔后，孔口若有霉菌出现，及时用饱和石灰水上清液或3％煤酚皂溶液涂抹孔口。
⑤保护环境清洁出菇期间，在采收第1批木耳后，每3～5天在地面喷1次1％石灰水，或1％～2％煤酚皂溶液，0.1％多菌灵，或交叉使用，以控制杂菌生长。每周在地面喷几次0.5％食盐水，还能防治线虫危害。
⑥室内发菌，室外出耳，被认为是木耳菌块栽培的一项有效的防霉措施。模拟野生木耳生态环境的室外耳棚，能透入适量阳光，改善通气状况，能加强耳片的蒸腾作用并提高代谢能力，从而提高了抗霉能力。
⑦加强水分管理，要根据菌块水分散失情况和空气流量。相对湿度大小，进行水分管理。以防菌块水分过高过低，引起菌丝衰老和死亡。
伪步行虫
伪步行虫俗名壳子虫，成虫椭圆形，体表有黑斑或红斑，具光泽，长约1厘米。其幼虫称鱼儿虫，体长约2厘米，形状如小鱼，颜色如小虾，是危害木耳的主要害虫，大量发生时，危害相当严重。成虫啮食耳片外层，幼虫危害耳片耳根，或钻入接种穴内至食耳芽，被害的耳根不再结耳。入库的干耳回潮后，仍可受到危害。幼虫排粪量大，呈黑褐色线条状。成虫寿命长，白天藏匿在栽培场所的枯枝落叶中，夜间出来活动。
防治方法
清除栽培场所的枯枝落叶，并喷洒200倍的敌敌畏药液，可杀灭潜伏的害虫。大量发生时，先摘除耳片，再用1000～1500倍的敌敌畏药液喷杀；也可用500～800倍的鱼藤精、500～800倍的除虫菊乳剂、1500倍的马拉硫磷防除，还可用1000～2000倍的50％可湿性敌百虫药液浸段木。在芒种和处暑期间，每次拣耳之后，都可用上述药物喷洒1次。
