联盟是指由企业、大学、科研机构或其他组织机构，以企业的发展需求和各方的共同利益为基础，以提升产业技术创新能力为目标，以具有法律约束力的契约为保障，形成的联合开发、优势互补、利益共享、风险共担的技术创新合作组织。值得注意的是，食用菌行业的联盟在近两年出现一个热潮，2014年11月29日，国家食用菌装备产业技术创新战略联盟在盐城成立；2014年12月29日，国家光伏食用菌产业技术创新战略联盟在青岛成立；2015年3月24日，国家黑木耳产业技术创新战略联盟在牡丹江成立。这些联盟均为科技部中国技术市场协会批复成立。针对行业内出现的多个联盟，李玉院士对易菇网讲到：食用菌产业走到目前阶段，确实需要这种资源共享、技术交流、设备能够公用的这种平台，否则我们重复投资，会造成资源的浪费，力量的浪费，人才培养的浪费，这些都是整个产业值得注意的。
李玉院士告诉易菇网，行业联盟的成立，仅仅做到“成立”、“挂牌”是远远不够的，应该要从实际上解决我国食用菌产业面临的一些主要问题。比如说菌种问题，现在食用菌工厂化的菌种还是被外国菌种所占据，占主导地位，我们急需要拿出自身的品种来。但是，成立行业联盟是有意义的。李玉院士指出，联盟能够提供了一个资源共享、技术交流、人才培养的平台，有效避免了重复投资、资源力量的浪费。利用这份共享机制，就能够进一步解决行业面临的种种问题，达成一个统一的标准。另外，联盟成立后，必然会形成相互监督的体制。若近期内实现这几个目标，那么我国食用菌产业才有可能真正做到又大又强。
据易菇网了解，食药用菌领域的联盟，远远不止以上这些联盟。单一种类的联盟，如于2013年成立的中国天麻产业联盟、2014年成立的中国虫草产业技术创新战略联盟，区域性的联盟先后成立的则有湖北省食用菌产业技术创新战略联盟、山西省食用菌产业技术创新战略联盟、首都食用菌产业科技创新服务联盟等。其中，2013年，由中华全国供销合作总社昆明食用菌研究所牵头，广东省微生物研究所、吉林农业大学等15家高校、科研院所及21家省内外企业共同组建的国家食用菌产业技术创新战略联盟被国家科技部正式批准列为国家级试点联盟，为目前唯一一个进入科技部的试点联盟。
针对行业内成立的众多联盟，李玉院士同时直言，目前只有少数联盟较具特色，个别联盟从业者还有微词。李玉院士认为：食用菌行业这些联盟下一步应该进行联合，需要考虑再“联盟”，行业不可能需有这么多的平台，这中间也有重复建设的问题，力量分散的问题。虽然它各有侧重，但是要真正的想起到联盟创建的初衷，应该真正实现大联合，真正建设平台，真正整合资源力量，整合管理层面的东西，才能真正起到联盟的作用。
