图片来源：陈体强研究员
2021年11月9日，福建省农业科学院食用菌研究所创新团队在《生物技术通报》在线发表研究论文，采用 PacBio SMART 技术并基于三代和二代数据（3+2 策略）完成紫芝栽培品种‘武芝 2 号’（原名：S2）（通称‘紫芝 S2’）De novo 测序、组装，获得序列总长度 56.849 Mb 的全基因组，包括72条 Scaffolds，其中71条Scaffolds构成核基因组，另外1条（序列长度 85.389 kb）为完整的线粒体基因组。其中，核基因组16681个基因，完成13161个基因的注释（约占总数的 78.89%），预测分析到4 组串联重复的 rRNA基因簇(18S,5.8S,28S,5S rRNA )、405个非编码 RNA和 3305个启动子，并找到 rpb2、beta-tubulin、terf-1α、CaM和Mn-SOD等基因序列以及漆酶同工酶基因，鲨烯合酶、羊毛甾醇合酶基因与麦角甾醇合成代谢相关基因、交配型基因座mat A&B及其分布位置，并发现一种新的真菌免疫调节蛋白fip编码基因。为今后紫芝栽培品种（系）分子鉴定与菌株鉴别、功能基因的挖掘与利用提供可靠信息，同时也为其后续开展中国栽培灵芝种类的比较基因组学分析积累科学数据。
据悉，‘武芝 2 号’是目前国内唯一实现商品化栽培的紫芝品种，于2005年从福建省野生紫芝种质资源中选育得到，2012年通过福建省非主要作物品种认定；近年来，在福建、广东及广西等地推广应用形成年产量达3000吨以上的规模化栽培。该基因组计划始于2018年，依托特色食用菌繁育与栽培国家地方（福建省农业科学院）联合工程研究中心、福建省农业科学院药用植物研究中心、福建农林大学和中国医学科学院药用植物研究所的科研平台完成。
作者简介：陈体强，福建省农业科学院，研究员。1989年起从事闽产赤芝、紫芝、建青黛等药用真菌与中药材研究逾30年。先后发表60多篇有关灵芝研究论文，其中15篇SCI收录，出版《福建原木灵芝研究》专著1本，获得国家发明专利1项、栽培品种认定1个，先后有4项灵芝科研成果获得（2007、2012、2013、2014年）福建省科学技术奖。近年来，先后在福建中医药大学药学院、福建农林大学食品科学学学院、华侨大学生物医学学院担任过校外研究生导师；现为中国菌物学会灵芝与健康产业分会理事、福建省微生物学会药用真菌专业委员会副主任委员、福建省药学会中药与天然药物专业委员会常务委员。
