灭菌在食用菌生产中是一个最重要的环节,它主要是达到熟化培养料有利于食用菌菌丝分解吸收培养料中的营养生长,缩短生长期,提高产量,还有就是起到杀灭培养料中的杂菌达到无菌状态为食用菌的生产创造一个良好的生长条件,防止杂菌与其争夺营养影响生长等作用,基于这两个主要作用,视不同食用菌具体品种的适应性和分解力的强弱来确定灭菌时间的长短较好掌握,前提条件是不影响其正常生长和产量来区分较好.如适应性强分解力强的菇类,如平菇、榆黄菇、姬菇、香菇、杏鲍菇等灭菌时间可比熟料时间短一半较好，如再缩短灭菌时间菌丝生长就会变慢，生长期和出菇期就会延长、产量也会有所减少，有可能还会出现营养供应不足出现畸形菇。如果是一些菌丝在熟料培养基上生长就慢的菌类、珍稀食用菌类，最好用熟料，否则如果灭菌时间变短，菌丝就难在未熟化的培养基上生长，或直接不长，所以灭菌时间不是越短越好，也不是越长越好（因太长费燃料增加成本），视具体情况而定。
