随着我国茯苓道地药材优化缩减，野生资源改为人工栽培，茯苓资源栽培格局发生了变化。王文全教授介绍，市场流通的一级茯苓菌种主要流向相关科研机构、较有实力的茯苓企业、小规模的专业种植，二级、三级茯苓菌种则就地销售给地方农户。在生产上使用的茯苓菌种，报道菌种40余种，各地有自主菌种。湖南湘靖•28，全国各地均有采购，中国科学院微生物研究所的5•78，大别山地区仍然在使用。不同产区茯苓生产方式也在传统生产工艺上得到不断优化，如“大料变小料”，“长料变短料”，在传统的“木引”“肉引”基础上，优化为“嫁接法、诱引法、双引法”。培养基物料种类也不断革新，茯苓代料栽培技术为挽救林木流失、茯苓产业可持续发展，提供了创新性的技术支撑。技术科研进展上，李剑、王克勤、苏玮等，开展了棚室内以代料方法栽培茯苓的研究，代料以松木屑、松枝碎块为主要原料，配以石膏、蔗糖等。祺研究以松根62.5%、松木屑9.5%、米糠14.5%、玉米芯11.5%、蔗糖1%，取得较好的试验效果。在科研成功推动上，湖南补天药业公司主持的“大宗道地药材茯苓栽培与加工关键技术研究及产业化”荣获2013年度湖南省人民政府科技进步一等奖。生产技术规范化程度逐步提高，生长发育周期由10~12个月缩至6~8个月。各产地加工模式也呈现多样化，通过“发汗”，晾至表面干，反复数次，阴干后得到“茯苓个”；将鲜茯苓切制，阴干后得到“茯苓块”和“茯苓片”。茯苓采收加工模式有“鲜茯苓采收-发汗-剥皮-切制-干燥”，“鲜茯苓采收-发汗-蒸制-剥皮-切制-干燥”，“鲜茯苓采收-蒸制-剥皮-切制-干燥”，“鲜茯苓采收-切制-干燥”，有的加工还用了蒸制工艺。
