一、现蕾期管理
金针菇出菇后，第一个生长时期就是现蕾期了，这时的菌丝基本都生长完毕，开始慢慢长出子实体，如果这时光照和通风工作没有做好，会降低空气内的湿度，对它的生长发育是极其不利的，因此需要定时进行通风工作，增加菇房内的氧气含量，有利于菇体的生长，同时也要增加菇房里的光照时间，才可以保证菇房内的湿度，最好是控制在85%以上，这样更有利于菌体的生长发育。
二、驯养期管理
出菇后的第二个阶段就是驯养期间了，这时的管理非常重要，在菌体长到1~2厘米的时候，需要对菇房的湿度做出一定的调整，最好控制湿度在70%左右，过高过低都会对子实体的生长造成一定的影响，导致出菇不齐。而为了对子实体进行驯养，需要将温度适度提高6~8度，等到驯养结束之后，再将温度提升一些，这样做的目的是为了加快菇体的生长速度，在这个环境下，金针菇的生长也比较整齐。
三、伸长期管理
最后一个阶段就是伸长期了，在这时的管理对其出菇是否整齐有着非常大的影响，通常情况下，子实体生长到3厘米左右时，是它的生长旺盛期，为了促进其菇体的生长速度，可以将菌袋全部打开，从而使更多的氧气进入其中来促进菇体伸长，让它生长得更为整齐。此外，对温度的把控也是有一定要求的，最好维持在10度的温度环境下，并且维持85%左右的湿度，如果湿度过低的话，可以采取洒水的方法来增加空气中的湿度，但具体的洒水量还需要根据它的生长速度酌情来决定，通常情况下，在它的生长中期，对水分的需求量较大，因此需要多喷些水。另外，对菌菇进行弱光照射也可以促进它的生长速度，使生长变得整齐。
