菇木上堆后，要在堆垛上覆盖树枝树叶以保温保湿。三月底以前接种的菇木，最好用塑料薄膜覆盖，并且每隔4~5天在中午气温高时揭开薄膜两侧通风。接种后20天左右，如接种孔呈现白或黄褐色，则表明菌丝生长正常;如接种孔呈黑色，则表明菌种已死，应补种。香菇菇木的发菌管理主要做好如下工作：
(1)遮荫控温
堆垛前期适值春暖，四周和堆垛盖小树枝叶，再覆盖一层塑料薄膜即可。菌丝定植后，如堆内温度超过20℃，应将薄膜去掉，并在四周和垛顶上盖较粗的树枝，以利通风换气。谷雨后，天气日暖，南方多雨，此时最好将地面遮荫改为搭凉棚遮荫。小暑以后，进入高温季节，要适当加厚遮荫，避免高温影响发菌。
(2)喷水调湿
夏季气温高，菇场水分蒸发快，除了遮阳降温外，还要注意保湿。尤其是天气晴热干燥时，更要注意喷水。如连续半月晴天，每次要喷水1~2h，喷水时间最好在下午五时以后。 通过1~2个月的定植发菌后，气候已逐渐转暖，正是杂菌孳生的时期。
(3)通风防污染
为防止杂菌污染，必须在保暖的前提下注意加强通风换气。
(4)翻堆
菇木所处位置不同，温湿条件不一致，发菌效果也不一样。为使菇木发菌一致，必须定时进行翻堆。翻堆就是将菇木上下左右内外调换一下位置。第一次翻堆应在定植后30~50天内进行，以后随着气温升高，每隔10~15天翻堆一次。勤翻堆可加强通风换气，抑制木霍等杂菌污染。翻堆时要注意保护树皮，出蕾后应停止翻堆。
出菇管理
段木接种后，经过春、夏几个月的发菌和养菌，菇木内菌丝已发育成熟，较细的菇木已具备出菇条件(较粗菇木或某些树种，往往要经过两个夏季才能大量出菇)，如菇木树皮颜色鲜明而有光泽，敲打时发出浊音，树皮柔软而有弹性，粗糙不平或有瘤状突起，皮下呈黄褐色，发出浓厚的香菇气味，此时应立木出菇，并进行温、光、水、气调节。立木前要浇一次水催菇蕾，要细水轻浇，也可连续轻浇24h，使菇木充分吸水达60%，然后覆盖薄膜保温保湿，促生菇蕾。当菇木大量现蕾时，即可立木出菇。
立木场要具备七分阴三分阳，空气湿度略高，排水良好等条件。立木前应将地面打扫干净，架设人字形木杈，木权上再绑一根长横木，横木距地面60~70cm，再将菇木成人字形交错排放在横木上。人字形菇木应南北向排放，以利受光均匀。立木后要轻喷勤喷水，保持菇场空气湿度85%左右。有条件的应在菇场安装喷水设备，设立风障，这些都是获得高产的有效措施。
