银耳是典型的双菌丝类型，即生育期需要香灰菌对培养基进行降解才能被银耳菌丝吸收，同时其生产过程对环境条件尤其是湿度、温度要求较高，当日光温室银耳即将进入耳芽发生和发育管理阶段，以下管理意见可供参考。
一、耳芽发生期
接种后经控温培养，第11天前后接种口菌丝呈现清晰的辐射状菌丝圈，并有黑灰色色斑出现。掀开胶布可在接种穴内看见白色菌丝团，此时应进入耳芽发生期管理阶段并进入出菇温室，耳芽发生期管理应注意以下几点：
1、出菇温室消毒。应提前3天按常规方法对出菇温室清洗、消毒、通风，再将菌棒放入出菇房单层码放，棒间距为1 cm。
2、开口增氧。接种后经11天左右可开口增氧，促使香灰菌丝向菌棒内部深度蔓延并诱导原基形成。方法是将棒面上胶布块揭起一角，接种穴内己形成绿豆大小的白色菌丝团，揭胶布同时顺手将白色菌丝团拱成半圆形，再把胶布边贴在接种穴周边，使其形成一个黄豆粒大小的通气孔。菌棒侧放或接种口朝下，以避免管理过程中水滴入穴，造成污染。
3、控制温度。增氧后，菌丝代谢加快，菌棒温度和出菇室内温度均会上升，一般会比室温高出2-3℃，此时应控制温度，勿使室温超过28℃，否则会使耳基发黑并大幅减产。
4、喷水加湿，促进生理成熟。开口12小时后，开始用超声加湿器直接向菌棒喷雾，每天3-4次。其目的是迫使菌棒从营养生长转入生殖生长。以穴口胶布背面有水珠为度。空气相对湿度掌握在80%-85%。每次加湿后，新风进气30分钟。
5、及时清理黄水珠。一般在胶布开口2天后，种穴内白色菌丝团就不断地分泌出淡黄水珠，这是生理成熟的标志，也是出耳的先兆。若菌棒侧放或斜放，黄水珠会自行流出，如接种穴存黄水珠，注意要及时用洁净脱脂棉团或吸水纸吸干。
6、通风换气。淡黄水珠出现后，耳芽需氧量增大，为了防止栽培室内二氧化碳浓度过高，应在早晚结合喷水进行通风换气，时间以20-30分钟为宜，每天3-4次。
二、子实体发育期的管理
当接种穴内白色菌丝团逐渐胶质化，形成碎米状的耳芽时，标志已进入幼耳期。幼耳期到成耳期，应采取以下管理措施：
1、揭胶布，盖报纸。在接种后的第14-16天，将接种穴上胶布全撕掉，促进耳芽继续发育。菌棒依然侧放或接种口朝下，再覆盖整张旧报纸，随即加湿喷雾，以保持报纸湿润和表面不积水为度。如发现耳芽黄水珠较多时，减少加湿喷雾，增加通风，使耳芽保持晶粒状，促进耳芽顺利膨大。
2、割膜扩穴。胶布去除，耳芽发育需氧量逐日增加，菌棒黑斑纹加深，幼耳膨大，即可割膜扩穴口。一般在接种后第17-18天进行，方法是用锋利刀片沿穴口边缘1cm处将塑料薄膜割掉，使穴口直径扩增至4-5cm。以增加接种口氧气量，促进幼耳的发育并转入子实体伸展期，注意勿划伤菌丝。
3、提高空气相对湿度。维持较高的空气相对湿度是喜湿性银耳所必需的，空气相对湿度应维持在90%-95%，若低于85%，幼耳易发黄;高于95%易出现烂耳现象。但实际栽培中并非始终维持高湿，而应干湿交替，也就是每隔4-5天，停止加湿1天，让幼耳露出通风12-24小时(视气温与空气湿度而定)，再次加湿。
加湿量和通风时间视幼耳生长状况，出菇温室内温度、空气、湿度而定。耳蕊多、耳黄、气温高时，应多加湿;耳蕊少、耳白、气温低时，应少喷。每次喷雾后均应通风10-20分钟再关门。
4、注意通风。银耳子实体进入成熟期，活力较强，棒温较高，控制出菇室温度不超过26℃，子实体生育期最佳温度范围为18-21℃，加大新风量并注意防止耳片干燥。
5、成熟期。银耳成熟期的标志是耳片全展开，疏松，触摸后弹性减弱(一般是在接种后第35天左右)。采收前管理工作以降低空气相对湿度和增加供氧量为中心。若出菇温室一直保持高湿，将会引起烂耳。需采收前5-10天逐渐减少空气加湿的次数，增加通风次数并延长通风时间，使出菇温室湿度降为80%，促使整朵耳中间尚未膨大的耳片继续膨大，耳片加厚，以获得优质商品耳。
三、采收
用锋利刀片，沿耳基底部环割一圈，使整朵银耳脱离棒面，削除耳根部黑色部分，细心操作并保持朵形完整。采下的银耳可晾晒至干品或包装后进入鲜销市场。采收后，及时将菌棒清理运送出出菇温室，破袋分离后，将培养料堆制发酵作为基肥还田处理。
