原因一：品种选用
根据气候条件，引进其他品种前应先小范围试验，适宜本地栽培后再大面积推广。另外，引进菌种本身种性退化，制种技术欠缺、操作不规范，菌种多次传代保存，以四级甚至五级菌种作为三级种播种等，均会影响出菇。退化菌种表现为接种后萌发慢、菌丝弱、发菌慢、抗逆性差。迟迟不出菇或出菇少，严重者病害肆虐，导致生产失败。防治菌种退化最好掌握制种技术，直接制种用于生产，无制种条件的需购买正规三级种栽培。
原因二：培养料配制
培养料配方合理才能正常出菇，否则会导致气生菌丝多、病害严重、迟迟不出菇。
基本配方：麦草3000公斤、牛粪粉3000公斤、过磷酸钙60公斤、尿素60公斤、石灰粉80公斤、石膏粉80公斤、碳酸钙90公斤、“赛百09”1.5公斤、食用菌三维营养精素1.44公斤。发展沼气较好的地区可以加入适量沼渣，也可以采用沼液拌料。
培养料的发酵处理关系着栽培能否成功，生产上存在培养料发酵不均匀、原料生熟不一、酸化等现象，导致发菌困难、污染严重、出菇难。建议改用二次发酵技术，使培养料发酵均匀一致。习惯采用一次性发酵的，翻堆时按照“内外相换、上下相调”的原则，不要“一边倒”式翻堆，并在进棚前对培养料含水率、PH值等进行检查调整。
原因三：防治病虫
病虫潜伏于培养料中，播种后对双孢菇菌丝造成危害，导致出菇困难或不出菇。解决方法：彻底清理菇棚及周围环境卫生;用“百病傻”处理覆土，发菌和出菇阶段每隔3～7天喷施一次;在菇棚通风口和进风口出撒施石灰粉，以防害虫爬入。
原因四：菇棚管理
棚温过高或过低，含水量过大、渗水、菌丝自溶、盲目用药、菌丝生理不成熟等，均可导致不出菇。温度降至8℃以下时一般不再出菇，采取生火炉等方式加温也无法满足正常出菇时，应进入冬季管理阶段。打开通风孔使棚温继续下降，但要始终保持遮阴条件，不能让直射光进入。不再喷水强通风，使棚内温度降至60%以下。降湿后覆土很快失水，一般含水率可达20%以下，甚至更低，至春季气温回升后含水率可降至10%左右，土面发白呈松散状。停止用水后喷洒“赛百09”300倍液，以后每隔15天喷一次。喷施5%氯氰菊酯乳油100倍液，杀灭残存害虫，棚外地面解冻后每隔10天喷施一次。撒施灭鼠药，防治老鼠危害菇床。有条件的地方可以安装水温空调，升温至15℃左右。
