黑木耳的“流耳”又名“水烂耳”是细胞充水破裂的一种生理障碍现象。木耳流耳病是袋料栽培木耳过程中非常容易感染的一种病虫害。木耳一旦感染此病，轻则减产，重则绝收，严重影响菇农的经济效益，因此，对木耳流耳病的防治，要引起高度重视。其防治措施有：
1、气温高时及时降温：白天关闭耳棚门窗、窗口悬挂湿帘，喷水降温，夜间打开门窗通风降温，尽可能将温度控制在30摄氏度以内。在这样的温度条件下，不仅木耳出耳快，出耳齐，开片好，色泽正，而且线虫的生长繁殖受到一定的抑制，若温度超过30摄氏度，则线虫繁殖加快，容易产生流耳。
2、耳棚场地应有一定坡度，表层土以沙质土壤为好，以便于渗水。
3、水源清洁卫生，以洁净的深井水作水源最佳。
4、精心管理：木耳在不同的生长阶段对温度、湿度和通风的要求是不同的。在木耳原基形成期，保持相对湿度在80%左右，并适度通风。在原基分化形成期，珊瑚状耳芽相当幼嫩，此时相对湿度不宜过大，保持在80%-90%即可。在子实体生长阶段,为促进耳片快速生长，要坚持干干湿湿的原则（三干七湿），加大通风，相对湿度控制在90%-95%。当子实体耳片充分展开，边缘变薄，耳根收缩，八分成熟时即开始采收。
5、发生少量流耳时，先清除流耳，再用1%-2%的食盐水喷洒木耳，同时用5%的石灰水喷洒地面，以控制线虫、细菌和原生动物的进一步蔓延，然后用磷化铝密闭熏蒸24小时。
