套纸筒就是当有机金针菇长到一定高度时，在平栽的有机金针菇菌袋上再套一个高约12厘米的纸筒，但不适用于堆袋栽培的有机金针菇。套纸筒有三方面的好处：首先，可以限制菌柄、菌盖与外界空气的接触，控制供氧量，从而促进菌柄的伸长，抑制菌盖的生长。因为若供氧充足，金针菇的菌盖发育快，菌盖大，商品性降低，套纸筒则限制了空气的流动，减少了氧气对菌盖的供应，所以菌盖生长就慢，而氧气不足又会促进菌柄的快速生长。其次，可以抑制菌盖过早开伞，防止子实体倒伏。金针菇菌盖与菌柄的生长是相互制约的，当菌柄伸长生长时，菌盖的生长就会受到抑制，套纸筒后菌盖长得小，并且开伞慢。第三，可以减少菌盖见光，保证子实体的颜色洁白。
其实套纸筒很简单，菜农可将废旧报纸 (如果使用通气性好的牛皮纸最好)剪成12厘米宽的长条，然后按菌袋的直径卷成筒，当金针菇的子实体长出菌袋2～3厘米高时，将纸筒套在菌袋上。但是要注意纸筒与有机金针菇子实体不能接触，防止喷水时将纸筒弄湿，水滴接触到子实体后引起子实体变色，降低商品性。
