有机平菇重视填土的消毒处理：平菇菌墙栽培，子实体病害发病率高，与填土的不洁净有关。一定要取洁净的土，并在使用前进行消毒处理。填土应预备两种：供封边用的，要选黏性较大的土，以防菌墙漏水;内部填充的营养土，要选肥沃的菜园土。无论哪种土，都要在地表面10厘米以下挖取，并在阳光下晒3天，然后加入1%的石灰、0.1%的多菌灵拌匀消毒，营养土另加0.5%的磷肥、0.3%的尿素。
菌袋不可过长：菌墙栽培一头出菇，菌袋不宜过长，一般长25厘米较好。
不能过早垒菌墙：不能在菌袋刚发满菌丝时就脱袋垒墙，应在吐黄水以后，或开始形成原基时开始垒墙。垒墙时，生理成熟度一致的菌袋垒在一起，这样出菇整齐，管理方便。
菌墙内补水要适宜：应根据平菇生理需要及培养料的干湿情况适时、适量补水。前期菌袋内含水量高应少补水，使培养料湿度达到20%即可。采一潮菇后，可补1次大水。
调节空气和料面的湿度：采完一潮菇后，不仅要向菌墙内补水，还应给空气加湿，保持料面湿润。如发现料面太干，应喷水补湿，然后用薄膜覆盖，形成原基后，再揭去薄膜，并保持空气湿度在80%左右。
