栽培有机食用菌，原料有生料、发酵料、熟料三种处理方式。从生料到发酵料再到熟料，培养料的腐熟程度是由浅到深，营养成分的分解程度是由轻到重，杂菌基数是由多到少，但受外界杂菌的入侵程度是由难到易，从操作方面来讲是由简单到烦琐，从产量上看是由低到高，生产者应根据自己的情况，合理选择。
生料栽培：生料栽培即拌料完毕后不经任何处理而直接装袋接种的栽培方式。这种栽培方式简单易行，省工省时，但接种后发菌慢，接种量大，而且在发菌过程中会造成后发酵，导致高温烧菌。在炎热的夏季，高温多雨，若栽培方法不当，易造成生料酸化腐烂以致栽培失败。因此，生料栽培仅限于菌丝生长力强的平菇、草菇等。
发酵料栽培：发酵料栽培即是将原料拌匀后，按一定规格要求建堆，进入发酵工艺。当堆温达一定要求后，进行翻堆，一般要翻3～5次。通过发酵处理，可杀死培养料中的有害微生物和害虫，但操作麻烦，成本较高。平菇、草菇、双孢菇、鸡腿菇等都很适合发酵料栽培。
