1.空根白心 喷水少、湿度不够、覆土层含水不足、子实体得不到充足的水分等。总之，由于菇房湿度小，就会使菌柄产生白色髓变，发展到后来就形成空心。因此在生产中必须注意适时喷水，出菇期菇房的相对湿度要保持在85％以上。
2.水锈斑 在蘑菇多次喷水后，要求打开门窗0.5小时～1小时通风换气，以保持室内空气新鲜。否则，菇房内湿度过大，就会使蘑菇表面滞留小水滴，时间稍长形成铁锈色斑点。
3.红根 出菇前高温阶段用水过多，覆土层含水量过大，培养料偏酸以及追施糖料过多、通风不良等都可能形成红根。应注意使覆土的含水量保持在22％～25％之间，避开高温时喷水。追肥要适当，糖分要适量。如发现红根，可适当喷些石灰清水。
4.硬开伞和早开伞 菇室昼夜温差超过10℃以上，或遇冷空气袭击，均会造成硬开伞。出菇密度过大，温度过高，湿度过低以及子实体生长快而柄细盖薄等，均会提前开伞。防治方法是在温度聚变时房外加盖帐帘，保持室内温湿度的基本稳定。
5.畸形菇 通风不畅，菇房内二氧化碳浓度超过0.3％以上易出畸形菇；出菇部位过深，在土缝间长出的菇也往往畸形，要根据具体情况采取相应措施。在出菇期间如遇到23℃以上的连续高温则会招致大量死菇发生，因此要注意高温期及时通风降温。
