在利用金宝贝发酵剂处理食用菌栽培料过程中，培养料中的微生物分解碳水化合物，所产生的能量一部分用于微生物自身的生长繁殖，一部分以热能的形式释放出来。在此过程中氮素转化为菌体蛋白而残留下来，这种菌体是蘑菇的重要营养源。由于碳素的减少和氮素的残留，堆制过程中碳氮比减小。金宝贝发酵剂功能微生物发酵期间，金宝贝发酵剂中的功能微生物能够同化的碳素量，大体是堆肥总碳量的30％；而要同化这些碳素，还需要同化碳素量10％的氮素。如果堆肥中含有100千克碳素，微生物只能同化30千克，同时还需要搭配3千克氮素。否则微生物的同化作用不能顺利进行。初始堆肥中的碳素与氮素比例应为30～35:1，以33：1为最佳。蘑菇堆肥粪草成分的配比及加尿素的数量应严格按照这个要求。如果氮肥不足，就会明显影响蘑菇的产量;若氮肥过多，不但会造成浪费，还因碳氮比失调而导致出菇困难。在适当的范围内，堆肥的含氮量与产量呈正相关性。
