一、栽培羊肚菌，先要制作菌种，和接种培养。
菌种培养料可以用麦粒作为主料，加上其他配料构成，控制含水量在65%为宜。把培养料混拌均匀，装入600ml干净的罐头瓶子或者聚丙烯筒膜里。装培养料的时候要松紧适中，不要压太实，装到瓶颈处就好，用聚丙烯薄膜封口、装筐，随后灭菌处理。灭菌压强大约147千帕，温度121℃，灭菌两个半小时为宜。
接种培养需要待菌种瓶子温度降低至15℃左右时，在超净工作台等无论环境下接种。接种以后，菌瓶需要在17℃左右的培养室里培养，要求培养室环境干净整洁、干燥通风，且是暗光条件，菌种在这样适宜的培养下，通常19天左右，菌丝可以长满菌瓶。
二、林下栽培菌种相关事宜。
选择土层比较厚、沙石含量比较低、方便取水、且12月至翌年4月份不落叶的针叶林或常绿阔叶林为佳，林地郁密度要求在0.7左右，这样的林地环境，是作为林下栽培羊肚菌最佳场所。
通常在11月初，翻耕土壤9㎝左右，尽可能的耙碎土粒，要求绝大部分土粒直径不超过1.5㎝为宜。按照厢面宽1米、厢沟宽0.35米、沟深0.2米造厢。然后在厢面中间位置，横向开宽0.35米、深8㎝的播种沟。 整地建厢因地制宜，不要求整齐，根据树林地形以及树木位置灵活掌控。
在11月中下旬，气温下降至18℃以下时，首先将栽培菌种捣碎，湿透水，让菌丝吸足水分。每亩按照500袋用种量，将拌湿的菌种均匀撒在开好的播种沟内，覆盖细碎土4㎝，浇足水后即可。如果当时气候比较干燥，可选用覆盖地膜保湿。
三、栽培后管理措施。
栽种菌种覆土24小时内，需要用无污染干净的水，雾喷栽种厢面3、4次，要土层湿透。土层表面一旦发白发干，需要及时喷雾水保湿。在此两个礼拜内，如果厢面有杂草，可以采用手工拔草。以后到采收期，尽可能不要动土。
羊肚菌菌种通常播种至30天，菌丝就会蔓延出土层，土面上形成大量白色霜状物，就是分生孢子。此种情况，证明其菌丝生长成熟，开始进入到生殖转化阶段。这个时候可以在土面上补充有机营养物，促进羊肚菌子实体原基进行分化。
立春以后，气温回升到10℃时，要注意提高厢面的湿度，提高到80%为宜，如果气温升高12℃时，需要去掉厢面上覆盖的营养物，提高厢面湿度到85%为宜。此时，土面白色分生孢子凝结，开始逐步退化，转化形成羊肚菌的原基。那些土缝中间灰白色针尖状卵形，就是羊肚菌的原基，在适宜的环境下，这些原基就会进一步分化出羊肚菌的子实体。
四、采收事宜。
采收标准在羊肚菌子实体长到8㎝的高度，其伞状网眼充分张开、菌帽尚未干硬、菌柄仍旧呈黄色时，为最佳采摘时机。通常用锋利小刀，从羊肚菌基部贴土面处割下来，以不沾泥为宜。
鲜菇采收回来以后，要及时清洁干净，装箱冷藏保鲜。可以新鲜销售，也可能加工成冰冻羊肚菌，或者用烘干设备烘干包装出售都可以。
五、羊肚菌的虫害防治措施。
羊肚菌出菇期间，最易遭到的虫害是蛞蝓舔舐。防治时机选择开春，在羊肚菌原基分化之前，土面湿度调整80%以后，每亩地可以选用4.5㎏油茶的饼粕，均匀撒施在田间，或者用专用环保无公害药剂进行蛞蝓防治。
