中国食用菌商务网对全国菌种、菌需物资及投入品市场情况进行了不间断的市场情况调查，发现全国菌种、菌需物资及其各种投入品的市场不但非常之大，且较为混乱，在个别地区已严重影响到产业的发展，就全国而言已对可持续发展形成制约。
据调查全国菌种、菌需物资及投入品的市场份额在100亿元以上，占全年总产值（按400亿元计算）的30%以上，占直接生产成本的50%以上。其中菌袋全国需求就9亿元以上，菌种从一级种、二级种到三级栽培种年需求在30亿元以上。如我国北方地区滑子菇的三级栽培种仅辽宁庄河和岫岩、河北平泉、黑龙江林口等地年需求在600万袋左右，市值1000多万元。栽培基料棉子壳（不含木屑、秸秆）全国总需求约150万吨以上，产地批发每吨380元，总需求约57亿元，玉米粉及其它添加基料20亿元以上。所需各种肥类及药品约15亿元。各种设备年需求平均在5亿元左右（不含大型工厂化生设备）。这是非常大的市场，需求数字十分惊人。
菌种、菌需物资及投入品市场份额之大，这表明产业发展的需求大，从一定意义上讲是件好事。从管理上讲近年业随着产业的发展，各级政府主管部门及各地产业协会组织在市场规范上做了大量工作。如菌种管理，投入品管理等方面做了很多行之有效的基础性工作，有的工作是非常有建树的。但我们也必须面对一个现实，就是市场无序状况。近年来，因菌种而引起的生产单位和菇农减产、绝产的现象很多，仅2003年直接经济损失就近2亿元，个别地区还使用退化或异化的菌种；在菌需生产设备制造上除一些正规厂家外，在各地有很多非标设备进入市场，每年都有恶性生产事故发生，其中有些设备落后、效率低下；在投入品方面，如各类药品有的是小厂小店生产，不符合国家规定标准，致使菌类产品遭受污染，农药及有害成份严重超标，如此等等。由于菌种、菌需物资及投入品市场不规范，所以形成良莠不齐的状况。有很多优良菌种得不到推广，有很多好的产品（菌需物资及投入品）在市场上没有占据主流。
国家农业主管部门和中国食用菌协会，从2003年开始就对菌种、菌需物资及投入品的管理使用提出要求，有很多主产县（市）对菌种实施了有效管理办法，对各类菌需物资及投入品逐步实行准入制。这是从源头上保证我国食用菌产业化健康有序发展的根本之策。据了解有的主产县领导等自带队组织生产企业和种植大户到外地考察菌种、菌需物资（设备）及投入品的情况，了解市场，学习先进，进行交流。还有的企业领导走出国门、赴国外考察学习。这必将为中国食用菌产业的可持续发展起到积极作用。但由于我国地域辽阔，生产环境及从业者素质、资金及经济状况不同，特别是在市场经济状态下不可能对市场进行硬性控制。所以无论是食用菌生产管理部门，还是各级协会组织及从业者都应关注菌种、菌需物资及投入品的市场状况，参与市场净化工作，为规范市场献良策，为确保中国食用菌产业的健康有序发展而创造条件。
