二、有机食用菌生产的特殊要求
欧盟、美国和日本都对有机食用菌生产提出了特殊性要求和标准，而且绝大部分内容都是一致的，具体体现在以下几个方面：
首先，食用菌栽培不是以土壤为生产介质的，因而它不需要经历从非有机生产到有机生产的转化过程，这一点与其他农作物是有显著区别的。开展有机食用菌生产，一般只要在上一个非有机生产周期结束后，做好必要的卫生和准备工作，就可以引入有机生产管理。
其次，食用菌生产是以各种农林废料(农作物秸杆、木屑等)为主要原料的。发达国家和地区要求栽培有机食用菌的培养料必须绝对来自有机原料。在这里，以两种世界性栽培的食用菌——双孢蘑菇和香菇为例加以说明。
1、双孢蘑菇
欧盟和美国都规定，生产双孢蘑菇的作物秸杆和动物粪便必须来自有机种植的作物和有机饲养的牲畜，此外还要求作物不得有转基因成分，牲畜必须以福利方式饲养。考虑到难以获取足够的有机原料，欧盟规定，如果经证实，确实无法获得所需有机原料，占原料总重量(不含水和覆土)25%的培养料可以采用非有机来源的原料。
2、香菇
香菇是以段木或木屑为主要生产原料的。美国、日本和欧盟都规定段木和木屑必须取自无污染的原始森林，而且要保证木头的运输、加工过程中不被有毒、有害物质污染。
另外，各国和地区都尚未要求使用有机原料制成的菌种。和其他种植业一样，有机食用菌生产过程中不允许使用农药和消毒试剂。各国一致推荐使用蒸汽对菇房进行消毒，注意保持环境卫生，采用物理和生物的方法进行病虫害综合防治。使用过的有机食用菌培养料是宝贵的可再利用资源。通常情况下，使用过的有机培养料应运送到有机农场加工成有机肥料。
对于在某个食用菌农场里同时存在有机生产和非有机生产的情形，各国和地区都要求有机生产和非有机生产必须进行永久性隔离。而且，为防止交叉污染，有机生产和非有机生产之间相互转化通常也是不允许的。
