当前，食用菌界比较热门的是各地食用菌专业合作社如雨后竹笋般兴起，食用菌专业合作社是近年来兴起的一种新型食用菌合作经济组织，它由从事食用菌生产经营的菇农或企业自愿组织起来，按照合作制的原则进行生产、加工、经营、分配、管理等活动，以共同抵御风险、提高收益，是食用菌专业化、市场化发展的产物。虽业内人士对此众说纷纷，但毕竟代表了一种新事物。完善与发展食用菌专业合作社任重而道远。会长（理事长）作为食用菌专业合作社的法人代表，在其中具有关键的作用，因此，探讨如何当好食用菌专业合作社会长很有必要。
食用菌专业合作社会长一般都是由合作社中的种菇大户或种菇能人担任。相比其他菇农来说，当会长一定要眼界开阔，思想要解放，勇于创市场，勇于接受新品种、新技术，有创新观念，在合作社要有相当的感召力。但多数食用菌专业合作社在我国尚处于起始阶段，会长面临着如何对合作社进行科学系统管理；提高合作社管理层人员（秘书长、监事长）的整体素质；加强合作社的市场、合作、风险等防范意识；要根本上解决食用菌专业合作社在发展中所遇到的各种问题，会长仅凭以往的经验来管理，是不能适应当今市场激烈竞争的需要，因此，会长应深入学习现代企业管理理念,不断提高自我素养，促进食用菌专业合作社的健康、有序的发展。
食用菌专业合作社有无旺盛的生命力，关键要有一个良好的运行机制。所以，作为法人的会长首要工作是抓好合作社的规范化、制度等建设，确立好合作社章程，加强管理，强化工作职能，制订好管理人员的工作计划和岗位责任，从而调动管理人员的积极性。
菇户是食用菌专业合作社的最基础细胞，菇农的素质如何，直接关系到合作社能否发展和壮大。菇户加入食用菌合作社的目的很单纯，实质就是为了增加效益，受传统思想的约束，多数菇农对市场经济条件下合作组织的必要性、重要性认识不够，还是习惯满足于游兵散勇地单干，采用传统的模式生产经营，对市场不了解，缺乏基本的现代生产技能，缺乏合作所必备的市场观念、法制观念、诚信观念、组织观念等。合作社同菇户之间的关系就像一对出对象的男女青年，处的好就结婚，处的不好就分手，没有什么道理好讲的，少数菇户受市场利润的驱动，掺假使杂时有发生。因此，会长应明确职责、把握分寸，进行协调化解矛盾，让菇户与合作社互相尊重，互相支持，共同盈利。
一个食用菌合作社要不断前进，就要有优秀的会长，只有管理好一个团队，才能使合作社发展壮大。要使食用菌专业合作社充满朝气，从会长到副会长、秘书长、监事长，班子必须要保证团结，要是个一心干事业的班子，会长应把合作社的工作当作了自己份内的工作，当作实现个人价值的一部分，带领班子成员集体发挥应有的作用。
当今食用菌产业的市场竞争，在于突出自己的特色。会长应让食用菌专业合作社围绕当地的优势来组织菇农开展合作服务，根据合作社的实际，制定一个切实可行的食用菌专业合作社发展战略规划，完善食用菌产品质量标准，完善食用菌产品的生产、加工、贮藏、销售全过程及操作环境等方面的标准体系，促进食用菌产品质量上等级、上规格、上档次，会长要解决好分户生产、分散经营和产销脱节等问题，采取统一品种、统一购买菌需物品、药品、统一技术标准、统一市场销售、统一技术培训的办法，为合作社成员提供全程标准服务，使食用菌产量不断增加，规模不断扩大，从提高食用菌生产的比较效益。
食用菌专业合作社作为发展食用菌产业、促进菇农持续增收的合作经济组织，要着力培育新型菇农，引导菇农参与食用菌产品的生产与销售，能有效地实现了小菇户与大市场的对接。促使食用菌产业化经营，市场开拓是个重点和难点。会长要充分利用媒体广告以及博览会、招商会、网络营销、专题报道、展销会和公共关系等多种促销手段，进行食用菌产品的整合宣传，提高公众对本合作社食用菌产品的认知度，做大做强合作社品牌！