1、培养料调配不当
如果所用的培养料没有完全搅拌均匀，或是里面的尿素、石灰粉和其他物质过多，同时遇到了高温或刺孔通气后，这些物质就会对香菇造成损害，妨碍了菌丝的生长，最后导致菌丝直接死掉，或者出现烂棒的现象。
想防治的话就要严格的按照配方来调配培养料，首先就要充分的搅拌均匀，里面的任何物质都要按照比例来，不能过多或过少，否则都会影响到香菇的生长。此外在搅拌好之后再做高温处理，这样菌种的抗病力、适应力才会增强。
2、通风情况不好
在栽培的过程中，很多种植户不重视通风，要是通风的条件不好，室内的二氧化碳或是其它有毒气体的浓度就会过高，使菌丝在生长过程中出现氧不足的情况，从而导致香菇不能正常生长，在消耗了大量的氧分之后出现烂棒现象。
栽培时要注意通风，让室内的二氧化碳和有害气体散发出去，让里面的氧气可以得到平衡，但在通风时也要注意，不能一下子完全把通风口打风，要慢慢的打开，这样香菇才不会因为突然受冷而受到损害。
3、室内温度过高
香菇的栽培中，温度也是非常重要的，如果温度过高的话就会影响到它生长，菌物袋会因为温度的提高而上升，出现烧菌的现象，最后使菌丝生长变得脆弱，甚至直接死掉，也有可能发生烂棒的情况。
当室内的温度过高时，应及时通过通风来降低温度，也可以在培养室的周围搭上遮阳网，使室内的温度降下来。或者增加室内的湿气也可以，不过这种方法不适合在干燥高温的季节中使用，阴雨天气也不适宜，遇到阴雨的季节，还要通风和减湿的工作。
以上这些因素都会导致香菇烂棒，此外在栽培过程中也要注意，不能让香菇受到阳光的直射，因为阳光里的紫外线也会伤害到菌丝，使其被灼伤，到了一定的程度就会感染病菌，从而发生烂棒，培育室里应该保持黑暗，使菌丝可以正常生长。
