平菇出菇阶段，易被有害细菌侵染，故而常发生软腐病、斑点病等细菌性病害。一些采收过头茬平菇的菌袋两头出现了暗褐色水烂，导致二茬菇出菇困难。该种情况是由于细菌感染引起的软腐病。
平菇软腐病发生时，菌丝退化，料袋表面色泽发暗、变软、水烂，伴有臭味。发病原因：
1、平菇采收后，在料袋表面形成伤口较多，为有害细菌侵染料袋创造了“通道”，又加之部分菇农为了促进下茬菇来潮，而加大了喷水，造成料袋两头湿度过大，或有水滴，也利于细菌性病害发生。
2、近段时间，受到连阴雨天影响，棚内相对湿度过大，通风不良，棚温过低，从而诱发了该病的发生。
3、有些菇农在料袋进棚前，未对棚室进行杀菌消毒处理，从而有害细菌在遇到适宜环境条件下，侵害了菌袋。
建议菇农综合预防该病发生：
1、注意菌袋进棚前，对菇棚进行杀菌消毒处理，降低棚内的有害菌数量。可用生石灰进行地面处理，100斤/亩。也可通过药剂熏蒸的方法，如用百速烟剂，500克/亩，闭棚熏蒸时间在8—10小时。
2、调控棚内环境。采取夜间放风的措施，加大通风量，满足平菇出菇需要。白天为菇棚创造散射光的环境即可，菇棚棚面可采用放“花帘”措施。
3、药剂防治：可喷施农用链霉素5毫升＋50毫升绿风95＋绿芬威1号17克，既能防治细菌病害发生，又能促进下茬菇来潮，5天1次，连喷2次。
