夏季栽培双孢蘑菇因气温高、湿度大、杂菌基数高。此时应针对这些特点，分阶段地采取有效措施进行防治，可取得事半功倍的防治效果。
一、栽培发菌阶段防治
由于高湿度的影响，使得栽培发菌成功率大为降低，主要表现为发菌缓慢、菌丝无力、污染率高等。主要防治措施：
1. 菌种脱毒、调配基料
脱毒菌种可确保自身不携带病毒病菌，并有效提高抗性，这是生产的基础。研究证明，每250公斤棉籽壳原料中，加入50克食用菌三维营养精素(拌料型)，即可获得菌丝旺盛、抗性提高、长速加快、污染率和发病率大为降低等效果。
2. 严格培养、彻底消毒
培养棚内的彻底消毒杀菌，是发菌成功的重要保证条件之一。生产中对培养室(棚)内喷洒百病去无踪或百病傻，密闭2天后即可启用，在发菌期间，每5天左右喷洒一遍赛百09药物或蘑菇杀病灵，是行之有效的预防措施。
3. 通气排湿、细心管理
一方面，坚持晴朗天气的晚间和早上通风，使之空气新鲜；另一方面，培养室（棚）内放置生石灰块，使之降湿。但应注意，在无空调降温的条件下，应采取诸如强制通风等措施，细心管理，以确保发菌的成功。
二、出菇阶段的防治
实践证明，对食用菌生产中的病害，转变传统重“治”轻“防”观念，坚持“以防为主，防治并重”的原则，即可收到事半功倍的防治效果。生产中可参考下列措施：
1. 菇棚内外进行消杀。在清理卫生的基础上，棚外喷洒800倍多菌灵药液，棚内使用百病去无踪或赛百09进行地毯式喷洒，环境较差、老栽培棚可喷2次，曝晒2天后即可启用。
2. 拌料时加入赛百09药物，抑杀杂菌效果好，药物残留低，可有效降低发菌污染率。
3. 出菇阶段定期使用药物以保持良好环境。一般可使用赛百09药物对菇棚进行喷洒，环境较差的可使用百病傻药物，每5天喷1次，抑制或杀灭后来的病原菌等，以保持环境的相对洁净。
4. 发现病害彻底杀灭。上述措施配套使用，仍难以保证100%不发病。因此，生产中应注意观察，发现菌袋有病菌迹象时，即应对患处使用消霉王等药物予以杀灭，也可采用赛百09浸洗菌袋；当子实体初发病害，即应根据病症表现或病原菌品种予以用药。
