1．培养料配比不合理，拌料不均匀，尿素、过磷酸钙、石膏、石灰等添加物超量。
2．培养室长时间通气不良，二氧化碳浓度高，氧气不足，致使菌丝回菌，影响菌丝生长发育。
3．培养室长时间温度过高，超出了香菇适宜生长的温度范围，刺孔后堆温大幅度升高引起“烧菌”，造成菌丝生长脆弱甚至死亡。
4．阳光直射菌棒，强烈的紫外线烧伤菌袋内的菌丝，甚至菌丝被杀死，菌棒局部出现黄水，菌棒上淤积黄水过多影响通气，极易造成杂菌感染。
5．香菇生产环境空气湿度过高，给菌棒补水时水温过高，补水过多，高温闷热天气通风不良等原因导致菌棒烂棒。
6．采菇后没有及时清理菇根，由于没有完全转色好的菌棒和采菇人员技术不熟练，采菇时带下大块培养料造成菌丝受伤等，喷水后极易滋生霉菌导致菌棒烂棒。
