秋菇前期气温高，子实体呼吸旺盛，菇房内二氧化碳浓度高。因此，应加强菇房内的通风换气。当菇房内温度在18二氧化碳以上时，注意通风既不提高菇房内的温度，又不降低菇房内的空气湿度。因此，菇房的通风应在夜间和雨天进行，无风的天气南北窗可全部打开。有风的天气，只开背风窗。为解决通风与保湿的矛盾，门窗要挂草帘，并在草帘上喷水，这样进行通风时，也能保持菇房内湿度，还可避免热风直接吹到菇床上，避免使双孢菇发黄而影响双孢菇质量。
秋菇后期，气温下降，双孢菇减少，此时排出的二氧化碳和热量也相应降低。为保证子实体生长应适当减少通风次数，注意提高菇房内温度。当气温下降到14℃以下时通风应放在白天进行以便通风时提高菇房内温度。菇房内空气是否新鲜，主要以二氧化碳，的含量为指标，也可从双孢菇的生长情况和形态变化确定出氧气是否充足，如在通风较差的菇房，会出现柄长盖小的畸形菇，说明菇房内二氧化碳超标，需及时进行通风詹理。挑根补土
秋菇期间，每次采菇后，应及时将遗留在床面上的干瘪、变黄的老根和死菇剔除。若将老根和死菇继续留在土层，这些老根已失去吸收养分和结菇能力，时间一长还会发霉、腐烂，易引起绿色木霉和其它杂菌的侵染和害虫的孽生。每次割根后，应及时用湿润的细土将采菇时带走的泥土补上，以免喷水时，水渗透到培养料内而影响菌丝生长。
层架式双孢菇冬季管理水分管理
随着气温的逐渐降低，出菇的越来越少，双孢菇的新陈代谢过程随之减慢，对水分的消耗减少，土面水分的蒸发量也减少。必须及时减少床面用水量，改善土层内的通气状况，保持土层内菌丝的生活力。秋菇结束后，及时在培养料反面打扦戳洞，增加料内的透气性，排出料内有害气体，使料内菌丝能得以生息、复壮。当气温降至10℃以下时，床面要少喷水，降低土层湿度，一面让其自然出菇，一面安全的进入冬季“休眠状态”。当气温降至5℃以下时，为保持土层一定湿度，床面上每周只需喷1～2次水，保持细土不变白，稍湿润即可。通风换气
秋菇结束后，菇房除加强保温外，每天中午还必须适当通风。中午可开南窗进行通风1～2h，在天暖无风的情况下，中年也可开南北对窗通风口，5h左右。松土、除根、喷发菌水
冬季后期，为使土层内菌丝能够得以更好地恢复生长和发展，需要对土层进行～次全面的松动，挑除失去再生能力的老根和死菇，并排除土层内长期积累的有害气体和废弃物质。松土、除老根前，菇房需进行一次大通风，通风时间2～3天，使土层水分蒸发便于松动。松土的方法要根据具体情况灵活掌握。土层菌丝生长旺盛，需将细土刮到一边，翻动粗土，使板结的菌丝断裂，拔掉发黄干瘪的老根，再覆上细土，以促进菌丝更好的萌发。土层菌丝尚好，但板结不紧的菇房，只要刮开细土，拨动粗土，去掉死菇，然后再覆上细土。土层菌丝较差的菇房，不需刮开细土，只需要用小刀或小耙将粗、细土松动下即可。
松土及除老根后，需及时补充水分以利发菌。应在温度回升后喷洒，以便在有适当水分和适宜的温度下，促使菌丝萌发、生长。发菌水要一次用够，用量要保证恰到好处，防止用量不足或过多，使菌丝不能正常生长。发菌水总的用量一般为每平方米3kg左右，2～3天喷完，每天喷水1～2次。喷水后应适当进行通风。
春菇管理水分管理
冬季后期喷发菌水后1周左右，在土层间的越冬菌丝上开始出现新生的绒毛状菌丝。这些新萌发的菌丝抵抗力差，遇到十氏温、干燥等不良环境条件很容易萎缩。因此，无论在什么情况下，都不可随意喷水或打开门窗通风，应当尽力保持原有的稳定条件。早春气温变化大，既要预防低温，又要防止高温危害。在山东省，3月上中旬当气温稳定8～10℃，开始调节土面水分，用轻喷勤喷的方法，喷水量由少到多，随气温渐升，双孢菇大批出土，喷水量可相应增加，一般每天每平方米喷水300g左右。随着气温的升高，双孢菇陆续出菇后，可逐渐增加用水量。
温度、湿度及通风换气的调节
春季气候干燥，温度变化较大，因而要特别注意加强菇房的保温、保湿工作。尤其中国北方地区。春菇的菇房管理应以保温保湿为主，使菇房保持一个较为稳定的温湿环境，有利于菌丝的萌发和生长。同时利用选择不同时间通风、通风时间的长短和通风口调节菇房内温度和湿度。通风时严防干燥的西南风吹进菇房，以免引起土层菌丝变黄萎缩，失去结菇能力。
层架式双孢菇追有机肥
多潮出菇后，培养料中营养成分减少，菇型变小，薄皮菇增多，应适量追肥。
层架式双孢菇采收
双孢菇未开伞时营养奸，售价高。采收过迟易开伞，菌褶变红，品质下降，产量降低。还应根据市场消费习惯和加工厂需求适时采收。采收时，用拇指、食指和中指捏住菇盖，旋转采下，避免伤害周围小菇。菇稀可用手拔出，连老化菌根也带出。每天采收1次，一潮可采5～7天，采收后用利刀把菇柄切平，去掉杂质。运输包装应加软物衬垫，防止挤压和碰伤。
