冬季气温低，菌丝和子实体生长缓慢，呼吸强度低，出菇量少，但菇肉厚、品质好。广大菇农要抓住春节期间市场需求量大、冬菇畅销价高的时机，及时采取措施，争取多出菇、出好菇，实现较好的经济效益。具体管理措施如下：
提高菇床温度，创造出菇条件。冬季寒冷，需依托自然气温，结合人工调节提升温度。香菇大棚需揭去棚上的遮盖物，菇床上的薄膜除采菇时需揭开外，其余时间应盖紧；平菇大棚可将棚上的遮盖物摊稀；双孢菇大棚则在棚上额外覆盖一层薄膜。白天依靠自然阳光照射及菌丝自身的生物热量维持菇棚内温度，晚上在棚外加盖草苫防冻防霜。通常采取以上措施后，棚内温度可提高5℃—10℃，即使在寒冷冬季也能正常出菇。
补水控湿，保暖防寒。香菇、平菇经过发菌和秋季生长，菌棒失水较多，重量通常仅为原重的50％—60％，此时需及时补水。补水前应敞开棚门通风3—4天，补水时用注水针刺入菌棒内，借助水泵压力，让菌棒在短时间内吸足水分，水源以井水为宜。喷水需遵循“喷雾状水，菇多则多喷、菇少则少喷，蕾期多喷、采收期少喷”的原则。双孢菇冬季基本无需补水。
注意通风换气，避免北风袭击。菇蕾长出后，呼吸作用旺盛，若空气不流通，二氧化碳积累过多，会抑制子实体的形成与生长。通风换气应选择在气温较高的中午前后进行，每次10—20分钟。进出棚内操作时，需从棚的南侧进出，防止干冷寒风侵袭菇体。
