1.鲜藏 新鲜的有机平菇在室温3——5℃、空气相对湿度80%左右时，可贮存1周。温度增高，湿度也要增加。
2.冷藏 冷藏可以在接近0℃或稍高几度的冷藏室中进行，冷藏过程中要经常检查箱内的空气湿度，贮藏时间应控制在7天以内。
冷冻保鲜方法是将新鲜的有机平菇子实体在沸水或蒸汽中处理4——8分钟，放到1%柠檬酸溶液中迅速冷却，沥干水分后用塑料袋分装好，放冷库中贮藏，量少时可放冰箱中贮藏，能保鲜3——5天。
3.气调贮藏 适当降低环境中氧气的浓度，增加二氧化碳的浓度，可以抑制采摘后鲜菇的呼吸作用，延长保鲜期。有机平菇在低温下可耐25%的二氧化碳浓度。
在气调室内，从封闭时空气正常组成至达到要求的气体指标，有一个降氧气和升二氧化碳的过程，降氧期越短越好，这样贮藏的菇体可尽快脱离高氧气的环境，获得最佳的气调效果。
4.辐射处理贮藏 将成熟的有机平菇子实体用塑料袋封装，采用200千拉德剂量辐射处理，在15℃左右条件下贮藏，可保鲜2周左右。
