六、覆土后管理
覆土后，前期床面一般不调水，以保湿吊菇丝(湿度75%)。若低于要求的湿度，可轻喷增湿。
(1)调水通风。调水原则是先湿后干，调水总量力10千克/m2，分三天调入，采取两头轻、中间重的喷水法，每次喷水时，应打开门窗通风。
(2)喷结菇水。当菇丝普遍长到土缝中，便进行大通风3天，抑制菇丝生长，促进线毛状菇丝连成线状菇丝横躺在细土中，线状菇丝开始扭结成原基，便可喷结菇水。喷结菇水后，大通风2天，然后减少通风，促使菇丝向上生长(吊菇)，为以后持续出菇作好准备。
(3)喷出菇水。当蘑菇子实体普遍长到绿豆大小后，生长加快，需大量水分，就要喷“出菇水”。出菇水的用量和结菇水差不多，每25千克/m2，分5～6次喷，每次喷水量视床属子实体多少而定，菇多则多喷，菇少则少喷。喷水时间是在喷结菇水后的4～6天进行。喷水后，逐步减少菇房的通风量，增加菇房湿度，保持空气相对湿度90%左右。
七、秋菇管理
蘑菇从播种到采摘一般需40天左右。我县一股9月下旬出菇，12月下旬秋菇结束。秋菇一般可采5～6批。秋菇管理主要措施是喷水、通风、保温。
1、水分管理
做到看菇用水，菇多则多喷，前期多喷，后期少喷。秋菇前期喷水应在早、晚温度较低时进行。
2、通风及温、湿度控制
蘑菇生长发育中，需要吸收氧气，排出CO2，另外培养料中的微生物在分解增差换气，保持菇房空气新鲜，在子实体逐渐长到采收期间，要增加菇房湿度。出菇期相对湿度要达到90%。
3、清理床面
每批蘑菇采收完毕，要及时清理床面。用镊子剔除冬菇根和死菇，然后补覆细土，喷水，并打扫菇房。
4、追肥
当秋菇第三批采收结束，这时培养料里的养分已大量消耗，常会出观菇体小，出菇少的现象。因此，应适当追施禽粪、畜尿、尿素、豆浆、豆芽汁、麦芽或施用1、2号健壮素等。
八、越冬管理
冬季寒冷，菇房温度在5℃左右，不适合蘑菇子实体发育。这期间的管理内容是保温、通气。一般每隔7～8天喷一次清水，含水量达15%左右(土面保持不发白)即可。室内温度保持在3～4℃，正常天气、每天开窗2～3小时。到3月中旬，当温度稳定在10℃以上时，便可调水和补充营养，气温达15～25度时，是春菇出菇的最佳时期。
九、采收
菇盖直经2～4cm，菇环未破、菇伞未开的采收，要求菇无泥根、无虫蛀、无机械伤，高峰期要勤采(每天2～3次)。要做到“三轮”(轮采、切、放)，“三边”(边采、边切根、边分级)，“三快”(快收、快装、快运)，“一减少”(减少翻运次数)。
十、病虫害及其防治
蘑菇常见病虫害有：白腐病、软腐病、猝倒病、假蚊、蚤蝇、螨粪、跳虫、还有鼠妇等。防治方法主要是搞好菇房、培养料消毒，后发酵，注意菇房卫生，因病虫不同，适当用药(具体措施略)。
