5.3 灭菌。采用常压蒸汽式灭菌。方法是装袋结束后及时将料袋成井字形排垒在灭菌锅内灭菌，锅内袋与袋之间要留有一定的空隙，以利蒸汽通畅，防止局部灭菌不彻底。灭菌时要旺火猛攻，当料堆的温度达到100℃时开始计时，改用文火，保持24h以上，中途不停火，不降温，达到时间后停火降温，当料温冷却到60℃左右时趁热出锅。
5.4 接种。灭菌后的菌袋趁热搬进已经进行药物熏蒸的接种室，并检查是否有破孔(如有破孔趁热用胶布粘住)，菌袋进入接种室冷却到20℃以下进行接种。菌种要求菌龄在35～40d，菌丝洁白，健壮浓密均匀一致，无褐色菌膜，无杂菌，培养基无萎缩干枯衰老现象。接种前接种人员将所需菌种、接种工具及双手用75%酒精进行消毒后按各项无菌操作规程进行接种，并注意接种要迅速，一定要4h内接种完成，以防止感染杂菌。
5.5 发菌。接种后的菌袋放入发菌棚中，以四袋“井”字型摆放，堆高10层左右，排与排之间留10～40cm的通道。其温度控制在10℃～25℃，尽量恒温养菌；空气相对湿度控制在60%～70%；养菌后期注意通风换气；光照要选适量的散光，不能强光照射。当菌丝萌发至5cm左右时(即接种后的2周左右)进行第一次翻堆，并使菌穴侧向。菌丝萌发至10cm左右时(即接种后的5周左右)第二次翻堆，菌袋三袋呈三角形垒成排摆放，加大通风换气，并在菌丝萌发内部用打孔机刺孔。菌袋发满后就应二袋井字型摆放，常通风常翻堆，勤检查，及时挑选出污染袋。到菌丝开始扭结形成原基时，这时北方空气温度已偏高，尽可能不要动袋以防压损原基形成烂袋。
5.6 转色管理。香菇菌袋经数月的营养生长，已达到生理成熟期，表面形成隆起的瘤状物时要适当的通风，给予脱袋及一定的散射光照促其转色；菌袋绝大部分转成棕褐色时完成转色。
5.7 越夏管理。进入严热的夏季，这时气温高，不利于香菇菌丝生长。因此菌袋要在遮阴和通风条件较好的情况下进行管理，以便通风散热，严防“烧堆”。这时的管理要点为：① 袋内温度控制在28℃左右，空气相对湿度控制在60%左右；防阳光直射。② 不要过多翻动菌袋，避免人为震动而诱导菇蕾“早产”。③ 菌袋分泌黄色汁液时要及时刺孔排出，以防造成菌袋污染。
